Basic Information

Symbol
PPARGC1B
RNA class
mRNA
Alias
PPARG Coactivator 1 Beta PGC1B PERC Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma, Coactivator 1 Beta Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Coactivator 1-Beta PGC-1-Related Estrogen Receptor Alpha Coactivator PPAR-Gamma Coactivator 1-Beta PPARgamma Coactivator 1 Beta PPARGC-1-Beta Peroxisome Proliferative Activated Receptor, Gamma, Coactivator 1, Beta PPARAGCIbeta PGC-1(Beta) PGC-1-Beta PPARAGCIβ PPARAGCIB PPARGC1 ERRL1 PGC1
Location (GRCh38)
5:149729994-149855022
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_133263.4
Sequence length
10569.0 nt
GC content
0.5051

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3713.47 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3913.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2342.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001172698.2 NCBI
GACUCCGCCGCACGCUGCAGCCGCGGCUGGAAGAUGGCGGGGAACGACU… 10452 nt 0.5043
NM_001172699.2 NCBI
ACAUUCUCAUUUUAAUCCUCAAGCAACUCUGAAUUAGUUGCUGUUAUCC… 10541 nt 0.5035
NM_133263.4 NCBI
GACUCCGCCGCACGCUGCAGCCGCGGCUGGAAGAUGGCGGGGAACGACU… 10569 nt 0.5051
Summary

The protein encoded by this gene stimulates the activity of several transcription factors and nuclear receptors, including estrogen receptor alpha, nuclear respiratory factor 1, and glucocorticoid receptor. The encoded protein may be involved in fat oxidation, non-oxidative glucose metabolism, and the regulation of energy expenditure. This protein is downregulated in prediabetic and type 2 diabetes mellitus patients. Certain allelic variations in this gene increase the risk of the development of obesity. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PPARGC1B is expressed in basal brown adipocytes within interscapular brown adipose tissue, as identified through single-nucleus mRNA-sequencing [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252].