Basic Information

Symbol
PPIL2
RNA class
mRNA
Alias
Peptidylprolyl Isomerase Like 2 CYC4 Cyp-60 UBOX7 Probable Inactive Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase-Like 2 Peptidylprolyl Isomerase (Cyclophilin)-Like 2 RING-Type E3 Ubiquitin-Protein Ligase PPIL2 Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase-Like 2 U-Box Domain Containing 7 Cyclophilin-60 Rotamase PPIL2 HCyP-60 PPIase RING-Type E3 Ubiquitin Transferase Isomerase-Like 2 Peptidylprolyl Cis-Trans Isomerase Cyclophilin-Like Protein CyP-60 Cyclophilin-Like Protein Cyp-60 Cyclophilin, 60kDa EC 2.3.2.27 EC 5.2.1.8 CYP60 Cyp60
Location (GRCh38)
22:21666000-21700015
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014337.4
Sequence length
4068.0 nt
GC content
0.5622

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1510.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1579.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1107.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001317996.2 NCBI
AGUGGUCACGGAACUCGGCUGCGGCUCCAUGGUCUGAGUUGUCAGCCGU… 3698 nt 0.5579
NM_014337.4 NCBI
AGUGGUCACGGAACUCGGCUGCGGCUCCAUGGUCUGAGUUGUCAGCCGU… 4068 nt 0.5622
NM_148175.3 NCBI
AGUGGUCACGGAACUCGGCUGCGGCUCCAUGGUCUGAGUUGUCAGCCGU… 4926 nt 0.5260
NM_148176.3 NCBI
AGUGGUCACGGAACUCGGCUGCGGCUCCAUGGUCUGAGUUGUCAGCCGU… 2676 nt 0.5572
Summary

This gene is a member of the cyclophilin family of peptidylprolyl isomerases. The cyclophilins are a highly conserved ubiquitous family, members of which play an important role in protein folding, immunosuppression by cyclosporin A, and infection of HIV-1 virions. This protein interacts with the proteinase inhibitor eglin c and is localized in the nucleus. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the ubiquitin-mediated proteolysis pathway in cortical microglia, where PPIL2 was identified as a significantly dysregulated gene [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].