Basic Information

Symbol
PPIL4
RNA class
mRNA
Alias
Peptidylprolyl Isomerase Like 4 Peptidylprolyl Isomerase (Cyclophilin)-Like 4 Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase-Like 4 Cyclophilin-Like Protein PPIL4 Rotamase PPIL4 EC 5.2.1.8 PPIase Cyclophilin-Type Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase Serologically Defined Breast Cancer Antigen NY-BR-18 HDCME13P
Location (GRCh38)
6:149504495-149546092
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_139126.4
Sequence length
2475.0 nt
GC content
0.3628

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-590.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -640.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 546.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_139126.4 NCBI
CUCCUCCCGGGGUUUGUAGCGGAGGAGGAGCGGGCGCCAUGGCGGUUCU… 2475 nt 0.3628
Summary

This gene is a member of the cyclophilin family of peptidylprolyl isomerases. The cyclophilins are a highly conserved family, members of which play an important role in protein folding, immunosuppression by cyclosporin A, and infection of HIV-1 virions. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice selectively bred for high (MAHDR) or low (MALDR) methamphetamine intake identified the PPIL4 as a protein-coding gene overexpressed in the MAHDR line in the ventral midbrain, with this differential expression overlapping findings from a prior microarray study [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].