Basic Information

Symbol
PPL
RNA class
mRNA
Alias
Periplakin 195 KDa Cornified Envelope Precursor Protein 190 KDa Paraneoplastic Pemphigus Antigen KIAA0568
Location (GRCh38)
16:4882507-4960741
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002705.5
Sequence length
6251.0 nt
GC content
0.5953

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2505.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2604.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1568.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002705.5 NCBI
AGUCCGGGCUCCCCGCGCCGCCGCUCGCUCACCUGCGCUCCCGCCCGCC… 6251 nt 0.5953
Summary

The protein encoded by this gene is a component of desmosomes and of the epidermal cornified envelope in keratinocytes. The N-terminal domain of this protein interacts with the plasma membrane and its C-terminus interacts with intermediate filaments. Through its rod domain, this protein forms complexes with envoplakin. This protein may serve as a link between the cornified envelope and desmosomes as well as intermediate filaments. AKT1/PKB, a protein kinase mediating a variety of cell growth and survival signaling processes, is reported to interact with this protein, suggesting a possible role for this protein as a localization signal in AKT1-mediated signaling. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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