Basic Information

Symbol
PPP1CA
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 1 Catalytic Subunit Alpha PP-1A PP1alpha PPP1A PP1A Serine/Threonine-Protein Phosphatase PP1-Alpha Catalytic Subunit Protein Phosphatase 1, Catalytic Subunit, Alpha Isozyme EC 3.1.3.16 Serine/Threonine Protein Phosphatase PP1-Alpha 1 Catalytic Subunit Protein Phosphatase 1, Catalytic Subunit, Alpha Isoform Testicular Tissue Protein Li 155
Location (GRCh38)
11:67398179-67421183
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002708.4
Sequence length
1421.0 nt
GC content
0.5890

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-568.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -589.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 245.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008709.2 NCBI
AGGCCGGAAGGAGGCUGCCGGAGGGCGGGAGGCAGGAGCGGGCCAGGAG… 1454 nt 0.5915
NM_002708.4 NCBI
AGGCCGGAAGGAGGCUGCCGGAGGGCGGGAGGCAGGAGCGGGCCAGGAG… 1421 nt 0.5890
NM_206873.2 NCBI
AGGCCGGAAGGAGGCUGCCGGAGGGCGGGAGGCAGGAGCGGGCCAGGAG… 1289 nt 0.5896
Summary

The protein encoded by this gene is one of the three catalytic subunits of protein phosphatase 1 (PP1). This broadly expressed gene encodes the alpha subunit of the PP1 complex that associates with over 200 regulatory proteins to form holoenzymes which dephosphorylate their biological targets with high specificity. PP1 is a serine/threonine specific protein phosphatase known to be involved in the regulation of a variety of cellular processes, such as cell division, glycogen metabolism, muscle contractility, protein synthesis, and HIV-1 viral transcription. Increased PP1 activity has been observed in the end stage of heart failure. Studies suggest that PP1 is an important regulator of cardiac function and that PP1 deregulation is implicated in diabetes and multiple types of cancer. Three alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2020]

Forensic Context

A study in humans analyzing the temporal gene expression response to burn injury using a factorial time-course microarray method (TANOVA) identified the PPP1CA as having a main effect related to age, being classified into a group of genes related only to age and not burn injury, where it is involved in the production of nitric oxide and reactive oxygen species in macrophages [Zhou et al. DOI:10.1073/pnas.1002757107]. In a separate study in porcine skin investigating bromine-induced burns, the PPP1CA was identified as a signaling component with significantly increased expression specifically in the 45-second exposure group at 7 days post-exposure, where it is part of the insulin receptor signaling pathway [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007].