Basic Information

Symbol
PPP1CB
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 1 Catalytic Subunit Beta PP-1B PPP1beta PP1beta PP1B PP1c MP Serine/Threonine-Protein Phosphatase PP1-Beta Catalytic Subunit Protein Phosphatase 1, Catalytic Subunit, Beta Isozyme Myosin Phosphatase EC 3.1.3.16 PPP1CD Protein Phosphatase 1, Catalytic Subunit, Beta Isoform Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Li 80p Protein Phosphatase 1-Delta Protein Phosphatase 1-Beta EC 3.1.3.53 HEL-S-80p NSLH2
Location (GRCh38)
2:28751562-28802940
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002709.3
Sequence length
4916.0 nt
GC content
0.3572

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1217.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1317.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1742.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002709.3 NCBI
GCGGAGCUGGGCGGUGCCGAGGAGGAGGAGGUGGCGGCCUGGGUCUGAC… 4916 nt 0.3572
NM_206876.2 NCBI
GAGACUCGGCGCCGUGGACGUGGAGAGAGGGCGACGCACCUGCGCGAAG… 4925 nt 0.3620
Summary

The protein encoded by this gene is one of the three catalytic subunits of protein phosphatase 1 (PP1). PP1 is a serine/threonine specific protein phosphatase known to be involved in the regulation of a variety of cellular processes, such as cell division, glycogen metabolism, muscle contractility, protein synthesis, and HIV-1 viral transcription. Mouse studies suggest that PP1 functions as a suppressor of learning and memory. Two alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that binge-like ethanol consumption via a drinking-in-the-dark paradigm altered the expression of numerous genes in the prefrontal cortex, including the PPP1CB [Vallerini et al. DOI:10.1016/J.Neuroscience.2020.09.010].