Basic Information

Symbol
PPP1R12B
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 12B PP1bp55 MYPT2 Protein Phosphatase 1, Regulatory (Inhibitor) Subunit 12B Myosin Phosphatase-Targeting Subunit 2 Myosin Phosphatase Target Subunit 2 MGC131980 MGC87886 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 12B Myosin Phosphatase Regulatory Subunit Myosin Phosphatase, Target Subunit 2
Location (GRCh38)
1:202348666-202592706
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002481.4
Sequence length
15244.0 nt
GC content
0.4823

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5170.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5444.01 kcal/mol
Frequency: 3.58593e-193
Diversity: 4696.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001167857.2 NCBI
GGUACUACUGGCGGGAGGAGUAAAGAUGGCGGCGCGAGGGUCUCCGCCC… 1829 nt 0.5019
NM_001167858.2 NCBI
GGUACUACUGGCGGGAGGAGUAAAGAUGGCGGCGCGAGGGUCUCCGCCC… 1716 nt 0.5058
NM_001197131.1 NCBI
AGUGUCUAUCUGCAUCCUGAGGAACCAUGUCCUCUUUAUAUACCCGAAG… 8596 nt 0.4459
NM_001331029.2 NCBI
GGUACUACUGGCGGGAGGAGUAAAGAUGGCGGCGCGAGGGUCUCCGCCC… 15427 nt 0.4825
NM_001410283.1 NCBI
GGUACUACUGGCGGGAGGAGUAAAGAUGGCGGCGCGAGGGUCUCCGCCC… 15425 nt 0.4832
NM_002481.4 NCBI
GGUACUACUGGCGGGAGGAGUAAAGAUGGCGGCGCGAGGGUCUCCGCCC… 15244 nt 0.4823
NM_032103.3 NCBI
AGUUGAUUUUCCCAUGUUAGAAAAGGACAGUUGCUGGUACAAUCUCAUA… 13625 nt 0.4767
NM_032104.3 NCBI
AGUUGAUUUUCCCAUGUUAGAAAAGGACAGUUGCUGGUACAAUCUCAUA… 13806 nt 0.4778
Summary

Myosin phosphatase is a protein complex comprised of three subunits: a catalytic subunit (PP1c-delta, protein phosphatase 1, catalytic subunit delta), a large regulatory subunit (MYPT, myosin phosphatase target) and small regulatory subunit (sm-M20). Two isoforms of MYPT have been isolated--MYPT1 and MYPT2, the first of which is widely expressed, and the second of which may be specific to heart, skeletal muscle, and brain. Each of the MYPT isoforms functions to bind PP1c-delta and increase phosphatase activity. This locus encodes both MYTP2 and M20. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. Related pseudogenes have been defined on the Y chromosome. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the PPP1R12B as a shared downregulated differentially expressed gene between rhesus and adult human hypertrophic cardiomyopathy [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].