Basic Information

Symbol
PPP1R16B
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 16B ANKRD4 TGF-Beta-Inhibited Membrane-Associated Protein KIAA0823 TIMAP Protein Phosphatase 1, Regulatory (Inhibitor) Subunit 16B Protein Phosphatase 1 Regulatory Inhibitor Subunit 16B Ankyrin Repeat Domain-Containing Protein 4 Ankyrin Repeat Domain Protein 4 CAAX Box Protein TIMAP HTIMAP Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 16B
Location (GRCh38)
20:38804915-38923025
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015568.4
Sequence length
6259.0 nt
GC content
0.5451

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2458.18 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2563.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1436.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001172735.3 NCBI
AGAGCCAGCUCUGUCGCCGCUGGAGCAGCUGCGGCUCGGGGACCCACAG… 6133 nt 0.5436
NM_015568.4 NCBI
AGAGCCAGCUCUGUCGCCGCUGGAGCAGCUGCGGCUCGGGGACCCACAG… 6259 nt 0.5451
Summary

The protein encoded by this gene is membrane-associated and contains five ankyrin repeats, a protein phosphatase-1-interacting domain, and a carboxy-terminal CAAX box domain. Synthesis of the encoded protein is inhibited by transforming growth factor beta-1. The protein may bind to the membrane through its CAAX box domain and may act as a signaling molecule through interaction with protein phosphatase-1. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms that may undergo similar processing to generate mature protein. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that perinatal lead (Pb) exposure altered adult hippocampal gene expression at single-cell resolution, identifying the PPP1R16B as a top marker gene for oligodendrocyte progenitor cells in cluster 5 [Bakulski et al. DOI:10.1093/toxsci/kfaa069]. In human forensic research, whole transcriptome sequencing of heart tissue from sudden unexplained death (SUD) cases identified the PPP1R16B as significantly upregulated in the "primary normal" SUD subgroup compared to heart-healthy controls [Neubauer et al. DOI:10.1007/S00414-025-03414-4].