Basic Information

Symbol
PPP1R21
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 21 FERRY2 Fy-2 CCDC128 KLRAQ1 Ferry Endosomal RAB5 Effector Complex Subunit 2 Coiled-Coil Domain-Containing Protein 128 Coiled-Coil Domain Containing 128 KLRAQ Motif-Containing Protein 1 KLRAQ Motif Containing 1 FLJ16566 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 21 NEDHFBA
Location (GRCh38)
2:48440598-48515391
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001135629.3
Sequence length
3173.0 nt
GC content
0.4355

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-936.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -994.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 795.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135629.3 NCBI
ACUCCACCUUCCUCCCACCCCGGGAACCCGGAAGUGGAGGAGGAGGCGC… 3173 nt 0.4355
NM_001193475.2 NCBI
ACUCCACCUUCCUCCCACCCCGGGAACCCGGAAGUGGAGGAGGAGGCGC… 3047 nt 0.4322
NM_152994.5 NCBI
ACUCCACCUUCCUCCCACCCCGGGAACCCGGAAGUGGAGGAGGAGGCGC… 3140 nt 0.4354
Summary

Enables RNA binding activity. Located in early endosome. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that irradiation induced gastric injury and altered mRNA expression, with the PPP1R21 being significantly upregulated in irradiated gastric tissues alongside other dysregulated transcripts [Chen et al. DOI:10.1177/1559325819886766].