Basic Information

Symbol
PPP1R3B
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 3B PPP1R4 PP1 Subunit R4 GL Hepatic Glycogen-Targeting Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit GL Protein Phosphatase 1, Regulatory (Inhibitor) Subunit 3B Protein Phosphatase 1 Regulatory Subunit 4 Hepatic Glycogen-Targeting Subunit, G(L) FLJ14005 PTG Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 3B Protein Phosphatase 1 Subunit GL
Location (GRCh38)
8:9136255-9151574
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024607.4
Sequence length
5510.0 nt
GC content
0.4539

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1700.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1806.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1336.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001201329.2 NCBI
GAGUCCCGGGUGACUGCUGGAGGGAGGAGGUGACCGCGCAGCUCUCGUG… 5607 nt 0.4594
NM_024607.4 NCBI
ACACACCGACGCUCACGUAGUCGCGCUUGCCACAACCCUGCGGGCUCUC… 5510 nt 0.4539
Summary

This gene encodes the catalytic subunit of the serine/theonine phosphatase, protein phosphatase-1. The encoded protein is expressed in liver and skeletal muscle tissue and may be involved in regulating glycogen synthesis in these tissues. This gene may be a involved in type 2 diabetes and maturity-onset diabetes of the young. Alternate splicing results in multiple transcript variants that encode the same protein.[provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

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