Basic Information

Symbol
PPP2CA
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 2 Catalytic Subunit Alpha PP2Calpha PP2AC Serine/Threonine-Protein Phosphatase 2A Catalytic Subunit Alpha Isoform Protein Phosphatase 2, Catalytic Subunit, Alpha Isozyme Replication Protein C EC 3.1.3.16 PP2A-Alpha RP-C Protein Phosphatase 2 (Formerly 2A), Catalytic Subunit, Alpha Isoform Protein Phosphatase 2A Catalytic Subunit, Alpha Isoform NEDLBA PP2CA HJS3
Location (GRCh38)
5:134193978-134226083
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002715.4
Sequence length
4582.0 nt
GC content
0.4075

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1283.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1376.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1350.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001355019.2 NCBI
AAAAUGGCGCCGUUCACUCGACUCCUGGGCUUUUGAGUCAGCCGGCCUU… 4614 nt 0.4003
NM_002715.4 NCBI
ACAGAGAGCCGAGCUCUGGAGCCUCAGCGAGCGGAGGAGGAGGCGCAGC… 4582 nt 0.4075
Summary

This gene encodes the phosphatase 2A catalytic subunit. Protein phosphatase 2A is one of the four major Ser/Thr phosphatases, and it is implicated in the negative control of cell growth and division. It consists of a common heteromeric core enzyme, which is composed of a catalytic subunit and a constant regulatory subunit, that associates with a variety of regulatory subunits. This gene encodes an alpha isoform of the catalytic subunit. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.