Basic Information

Symbol
PPP2CB
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 2 Catalytic Subunit Beta PP2Abeta Serine/Threonine-Protein Phosphatase 2A Catalytic Subunit Beta Isoform Protein Phosphatase 2, Catalytic Subunit, Beta Isozyme EC 3.1.3.16 PP2A-Beta Protein Phosphatase 2 (Formerly 2A), Catalytic Subunit, Beta Isoform Protein Phosphatase 2A Catalytic Subunit, Beta Isoform Protein Phosphatase Type 2A Catalytic Subunit Testicular Tissue Protein Li 146 PP2CB
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis

MANE select

Transcript ID
NM_001009552.2
Sequence length
1946.0 nt
GC content
0.4758

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-649.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -692.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 469.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.(((((.((((((((((....((((((((.((((((((.(((((((.(((((.(((((((((((......(((....)))))))))....))))))))))....((((((.((((.((.(.((((.((((....(((.((((.(.(((((((((((((.(((((((.((.(((((((......((..(.((((((.((((........)))))))))).)..))))))))).)).))))))).))).((((..((((((((((((.(...(((....)))).)))).))).)))))))))..))))).))))).))))).)))..)))))))).).)))))))).((((((((((....))))))...))))..)))).)))))))(((.((.....)).)))..(((((((((.(((((....((((((....((((((.((....))...)))))).((((((((((.(((.((.(((...))).(((((....((((((.............(((((((((..((.(((.....))))).....((((((((((....((((((((((..(((((((.....(((.....(((..(.((((((......)))))).)..)))))).....)))))))))))))))))((.(((((.......((((.((((((((((..((((((((..........((((((((......)))))))).......)))))))).((((.((((((((......(((....)))..)))))))).))))((((((.(.((((.((.(((.....))))).)))).).))))))))))).))))))))).(((((((((.((((.......)))).)))).)))))..(((((.....)))))))))).))..))))))))))....((((((((((.(.((((((((((........))...))).....))))).)..))))))))))....(((((((..(((......(((((((((........))))))))))))..)))))))))))))))).......))))))....))))).(((((....))))).)).)))))).)))))))))))))(((.(((.((.(((((((((.....(((((((((((.(.(.(.((((..((((...(((((........)))))........))))..)))).).).).))))..........)))))))......))))))))).))))).)))..))))).))).....)))))))))))))))))).))))....))).))))((((((((((..........((....))........)))).))))))....((((((((((.....................)))))))..))).......))).)))))..........(((..(((((.(((((.....(((.....))).(((((((.((((.......((((((((.((((.........(((((((..(((((.(((...))).))))))))))))......((((((..(((....(((((..(((........))))))))....)))....)))))))))).))).)))))......)).)).))))))).....(((((((((...(((((..((.((((((((...(((((((......((((((...)))))).......)))))))....))))))))...)).........)))))...))))))))).......((((((....))))))..((((((((((.((((..((((..(((.((.........................)).))).))))))))..)))))))))).......))))).)))))..)))......((((((.((....)).))))))..))))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,((((((((((({(...(((((((.,..((((((({{((((((((.{((({{{.(((((.((((({{{(((,,{{{.{((....}}},)))}),,,.))))))))))..,,((((((.((((.((.(.((({{((((..{.(((.((((.(.(((((((((((((.(((((((.((.((((({({.....((..(.((({(,{((((........)))))})))).),,))))))))).)).))))))).))).((((..((((((((((((.(..,(((....)))).)))).))).))))}))))..)))))}}))))}})))).))).,)))))))).).))))))}}|||||{{|||{..,,))}}}},,{||},..}})),))))))){|||{{,((({{.{((((((,..,,(.({(((((....,(((((....((((((.{(....}}...)))))).((((((((({,(((.(({({{,,.|||.(((((....(((((({({..........{((((((((.,({,(((.....))))).,...((((((((((,.,.((((((((((..{((((((,,,..,({....,,.,,},.{(((((,....,)))))}.......,,......))))))})))))))))){|.(((((.......((({.((((((((((,.((((((({,,...,,...{(((((((......))))))))..,,,..,))))))).((((.((((((((......{,,....}},..)))))))).)))),(((((.(.((((.((.(((.....))))).)))).).))))))))))).)))))}))).(((((((((.((((.......)))).)))).)))))..(((((.....)))))))))).}},.)))))))))).,,.((((((((((.{.((((((((.(.,,.....}}.,.)))}....})))).,..))))))))))}...(((((((..(((......(((((((((........))))))))))))..)))))))))))))))}....,,.})))))....))))).{{{{{,...)}))),,).))))))))))))))))))))))))}},,...((((((({{.....(((((((((((.(.{.{.((((..((((,..(((((........)))))..,.....))))..)))).}.).).)))),.........}))))))......}},))))))).,|,...}),.,,))))))),)))))))),.)))))))))))).))))...,))).)))).}))))).....}}}||},,((,,..}}..,,{((((.(((.(,{(((((((..(((((((....,.....,..,},.....})))))).((((.,{{,....,|||.}}}}...,,,.{((({{(((((.(((({.....(({.....})).(((((((.((((.......((((((((.{(((..,...,,,(((((((..(((((.(({...})).))))))))))))..|||.|||{{{||||{....{((((.,(({,,,,..,,|||}}}}),,}})},,,,,})))}})))}.)))}}))))......)).)).))))))).....{((((((.,.....}}}}}||.((((((((...(((((((..,...{(((({...}))))).......)))))))....))))))))...}}..,,...,.,,}}},,|}}}}},,,,.......((((({....)))))).,{{((((((((,((({,.((({.,{,({{({{,,....,,....,,,..,,,,,.},,}},.}}}}))),..)))))))))),...,..))))).)))))..,,,..}}}}}}.||)))))))}).))).)))},}}))))..............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAGAGAAGGGGAAAGACAAGUCGGGAGAGGCCGGUAGGCGUGAGGCGGG… 1946 nt 0.4758
Summary

This gene encodes the phosphatase 2A catalytic subunit. Protein phosphatase 2A is one of the four major Ser/Thr phosphatases, and it is implicated in the negative control of cell growth and division. It consists of a common heteromeric core enzyme, which is composed of a catalytic subunit and a constant regulatory subunit, that associates with a variety of regulatory subunits. This gene encodes a beta isoform of the catalytic subunit. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PPP2CB (Ppp2cb) is a negative regulator of RAS-RAC signaling, which down-regulates RAS-induced activation of NF-kB pathways, providing a late-stage mechanism to prevent chronic inflammation following thermal injury [Yang et al. DOI:10.1186/1471-2105-8-10].