Basic Information

Symbol
PPP2R2C
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit Bgamma B55gamma IMYPNO PR55G PR52 PP2A Subunit B Isoform Gamma MGC33570 IMYPNO1 Serine/Threonine-Protein Phosphatase 2A 55 KDa Regulatory Subunit B Gamma Isoform Protein Phosphatase 2 (Formerly 2A), Regulatory Subunit B (PR 52), Gamma Isoform Phosphoprotein Phosphatase 2A BR Gamma Regulatory Chain Protein Phosphatase 2, Regulatory Subunit B, Gamma Protein Phosphatase 2A1 B Gamma Subunit PP2A Subunit B Isoform PR55-Gamma PP2A Subunit B Isoform B55-Gamma PP2A Subunit B Isoform R2-Gamma B55-GAMMA
Location (GRCh38)
4:6320578-6563600
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020416.4
Sequence length
4450.0 nt
GC content
0.5281

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1588.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1668.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1041.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001206994.2 NCBI
GCAGCCGCCCGGAGGACGCCCGUCGCGGUCGCAGCCUGCGGAGCCGCCC… 4342 nt 0.5134
NM_001206995.2 NCBI
ACUCUCAUCACCCAGAAGCAGGGAGAAGGGCCUGCGGCUGCAGGCCUGG… 4184 nt 0.4998
NM_001206996.2 NCBI
AUGUGUUUUGGGGGAAACAGAGAGAAAGGUGUGGCCUCUCCACUUCUGU… 4297 nt 0.5010
NM_001363388.2 NCBI
AGCCCGGCUCGGCCCCGGCUUGGUCGGCGCAGCGCAGCGCCGCGCGCGU… 4526 nt 0.5307
NM_020416.4 NCBI
AGCCCGGCUCGGCCCCGGCUUGGUCGGCGCAGCGCAGCGCCGCGCGCGU… 4450 nt 0.5281
NM_181876.3 NCBI
AUGCAAAAAGUGGGGCCUGGAGAUGGGGCUGUCUUUUUUCUCCAAACAC… 4087 nt 0.4987
Summary

The product of this gene belongs to the phosphatase 2 regulatory subunit B family. Protein phosphatase 2 is one of the four major Ser/Thr phosphatases, and it is implicated in the negative control of cell growth and division. It consists of a common heteromeric core enzyme, which is composed of a catalytic subunit and a constant regulatory subunit, that associates with a variety of regulatory subunits. The B regulatory subunit might modulate substrate selectivity and catalytic activity. This gene encodes a gamma isoform of the regulatory subunit B55 subfamily. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human ovarian cancer samples identified the PPP2R2C as part of a multi-dimensional module (md-module 5) associated with the TGF-b signaling pathway, where it was included in the DNA methylation dimension and noted as a tumor suppressor [Zhang et al. DOI:10.1093/nar/gks725].