Basic Information

Symbol
PPP2R5A
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit B''Alpha Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit B'Alpha B56alpha PR61A B56A Serine/Threonine-Protein Phosphatase 2A 56 KDa Regulatory Subunit Alpha Isoform PR61alpha Protein Phosphatase 2, Regulatory Subunit B (B56), Alpha Isoform Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit B', Alpha PP2A B Subunit Isoform PR61-Alpha PP2A B Subunit Isoform B56-Alpha PP2A B Subunit Isoform B'-Alpha PP2A B Subunit Isoform R5-Alpha
Location (GRCh38)
1:212285357-212361863
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006243.4
Sequence length
3245.0 nt
GC content
0.4764

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1089.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1144.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 681.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001199756.2 NCBI
ACUUUAGAUUUCAAGUAUGUUAGCAGCAGUAAUUAGGGAUGUUUUCCUC… 2598 nt 0.3699
NM_006243.4 NCBI
AGUCGCCUGUACCAACCACCUUCUCAAGUUGUAGCGGUCGCUCGCCUGG… 3245 nt 0.4764
Summary

The product of this gene belongs to the phosphatase 2A regulatory subunit B family. Protein phosphatase 2A is one of the four major Ser/Thr phosphatases, and it is implicated in the negative control of cell growth and division. It consists of a common heteromeric core enzyme, which is composed of a catalytic subunit and a constant regulatory subunit, that associates with a variety of regulatory subunits. The B regulatory subunit might modulate substrate selectivity and catalytic activity. This gene encodes an alpha isoform of the regulatory subunit B56 subfamily. Alternative transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.