Basic Information

Symbol
PPP2R5C
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit B''Gamma Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit B'Gamma B56gamma PR61G B56G Serine/Threonine-Protein Phosphatase 2A 56 KDa Regulatory Subunit Gamma Isoform Renal Carcinoma Antigen NY-REN-29 Protein Phosphatase 2, Regulatory Subunit B (B56), Gamma Isoform Protein Phosphatase 2 Regulatory Subunit B', Gamma PP2A B Subunit Isoform PR61-Gamma PP2A B Subunit Isoform B56-Gamma PP2A B Subunit Isoform B'-Gamma PP2A B Subunit Isoform R5-Gamma B' Alpha Regulatory Subunit KIAA0044 HJS4
Location (GRCh38)
14:101761682-101927989
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352913.2
Sequence length
4630.0 nt
GC content
0.4186

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1311.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1402.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 947.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((((((((.((((..(((.(.((((......(...((....))...).......)))).)))))))).)))))))).))))))))((((....))))..(((.((((((((..((((((((((((.(..((..((....))....))..).)))))))))))).)))))))).)))((((((...............((((((((.(((....((((.((((((.((((.....((((.(((((.((((..(((((.((((............(((((....)))))...((((((((((((((...((((........((((........))))....(((.(((........)))))).))))..))))))).......)))))))..((....)).....................))))...........(((((..((.(((..(((.(((((...))))).)))))).))..))))).)))))..)))))))))...(((((((((..((((((...........)))))).)))))))))..(.((((((((..(((((..(((.......(((((((......))...)))))......)))..)))))...)))))))).)(((((((.......)))))))...))))....))))))))))....((((.((((............)))).))))((((((.(((..(((......))).)))..))))))...)))).....))).))))))))....((((((((((...((((((((.....(((((((.........)))))))....))))))))......((((((((.(((.((..((....((((((((((....))).))))))).........(((..............)))....))..))))))))))))).......(((((.(((((((.......((((((((......)))))))).(((((((...(((((((..((((((((((.(((.....(((..((...((((....))))...))..)))....(((((((........))))))).......((((((((((((((((......((((((((((.....(((((((((.(((.((((....(((((..((((.((((((....)))))).))))...)))))..))))))).))))).((((((.....((((............)))).....))))))...((((......))))))))))))))))))..(((((((((.......((((((((((.(.((((((((......))))(((.....)))....((((.........))))((((((((((.((((....))))))))..))))))..))))...).))))))))))..)))))))))....(((((((((.(.(((((((.(((((((...(((((.(((................))).)))))........((((((((((((((.....(((.((((.(((.(((.......)))...(((..((((..(((((.....)))))))))))).............))).))))..............((((....((...(((((............)))))...))...))))))).......))))).)))))))))(((((..((....)).)).)))...))))))))))))))...........(((((((((((((((.((((((..((((((......(((.....))).((((((((.((..(((((((..((..((((((((((.........(((((..(.(((.((((..(((((((((((((...(((((...((((..(((((....(((.((((((....)).))))))).(((.((((.((...)).)))))))..)))))..))))...)))))(((...((((.....))))....))).(((..((........))..))).....))))))))))......(((((..(((((.(((((((.......(((((..(((((..((((((((((((((((((.........(((((((.(((...))))))))))..(((((.(((....))).))))).(((.......)))(((((.......))))).........(((((((((((((.((((((((((......(((((...((((....((((((((((...(((.((.........(.((((...((((((..(((((((....(((..(((((((.....((((((((((((...)))))))))))).........)))))))..)))....))).)))))))))))))).))).))).)))))))))).((((((......(((((((((.....((((((((((((((((.(((.((((((((((..((((.((..(((((.(((((.((((((((..(((.((...((((((....))))))...)).).))((((((((((((((((.(.(((((..(.((...........)).)..))))).)))))).....(((((((((((......(((((..(((((...((((....)))))))))..)))))...)).)))))))))((.((..(((((.(((((.((((((((((((.(((......))).))))).....)))))))))))).)))))..)).)).((((((.....))))))((((..(((.((((..........(.((((((...(((((.......)))))..))))))).........)))).)))))))(((((((((.....((((...))))((........))............((((((((((((...(((.(((...))))))((((((...))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))..(((((((((((((......((((((((((....).)))))))))))))))).....))))))..))))))))))))).))))).))))))..)))).(((.((((..((......((((((((((((......((((((((((..((((((....))))))((((((((((...............(((((.((((.((.(((.((((((.....((((((.((((.(((((((...((..((((((.....(((((((..((((((......((((.((.........))..))))......))))))((.(.((((((.((.((((.....)))).)))))))).).)).............)))))))....))))))..)).......))))))))).)).)))))).....)))))).))).)))))))))))))))))))))))))).)))))(((((.((((.((...((.(((((((.(((.((((.......))))...))).)))))))))....))..))))))))))))))))..)))))))..)))).)))..))))))...)))(((((((......((..((((((((....))))))))))......))).)))).)))).))))))).))))).....))))))))).....))))))..............))))....)))))(((((.......)))))....))))))))))))))))).....(((........)))..)))))).)))))))))))))))))).)))))..)))))..........(((((((........)))))))..)))))))...(((((((..(((...)))..))))))).)))))..)))))................)))..))))..))).)...))))).)))))))))))).))))))).....))...))))))))..((((((.(((((.(((((.(((((..((((((((.....((((((....))))))..))))))))(((.((((((((....)))))))).))).....(((((....((((((((((..((...)).))))))))))..)))))..........((((((((........))))))))........((((((..........)))))).......))))).))))).)))))))))))...(((.....))).))))))))))))))....))))))))))))).((((.(.((((......)))).).)))).(((((....((((((............))))))..)))))...).)))))))))((((....))))..........(((.(((((..(((((((((((..........)))))))))))...))))).)))......))))....)))).))))))))...(((((((.....)))))))))))))))))..)))((((..(((((((((((.............))))))))))).))))(((((((.....)))))))....((.(((((((.....))))))).)).)))))))....))))))))))))))..)))))....)))))))))).)))))).(((((((..((......))..)))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.((((((((.((({{,(({.{.(({{....,,{,..((....|}...}....,.}))}},)))))))).)))))))).))))))))((((....))))..(((.(((((((({.((((((((((((.(..{(..((....))....))..).)))))))))))).)))))))).)))((((((...............((((((((.(((....((((.((((((.((((..{{{((((,((((,{((((..(((((.(({(,....,,,,...(((((....)))))...{(({{{{{{(((({...,{{|,|,,,,.,{{{{........}}},...,{{({({{{{......||||||.,}}}..}}}}}}}...,,,,))})))}..((....)).......||||,|,,,....................(((((..({.(((..(({.{((((...})))}.}))))).))..))))).)))))..)))))))))}}}|||{(((((..((((((.,,....,,..)))))).))))}},,,..{.((((((((..(((((..(((.......(((((((......))...)))))......)))..)))))...)))))))).,{{(((((,,.....}}}})))...)))),},.))))))))))....((({.((((..,,.....,,.)))).})))((((((.(((..(((......})).)))..))))))...)))).....))).))))))))....((((((((((...((((((((.....(((((((.........)))))))....))))))))....,.(((((({{{{(({,{.,{,..,.((((((((((....))).))))))).........,,{.,,...,......,|||,...})}}))))))))))))).......(((((.(((((((.......{(((((((,....,)))))))}.(((((((...(((((((..((((((((((.(((..,.,{((((((.((((((.....{{{{((({{{{{{.,{{({(((((.,{,,{{{|||||||..,(((((((....|))))}|{{...,}},|||||||{{{{{,{{...(((((.(({,((((....(((((..((((.((((((....)))))).))))...)))))..))))))).))))).||||||,,...({(({{,,..{{{,..,)))}...,||||,,...,|||},....,,,,,.|||||||||||}{,(((({{{{{..,.,,,|||||{{|{{.{,||{|(({{.....,)))){{{..,,|))),...|||},...,|||{{{{{((((((((((.((((....))))))))..)))))}..||||...,.))))||||||..}}}|||,,,.},},,,|||||},}.(((((((.(((((((...{((((,(((...,{{,.......,,||}.}}}}}.,,,,...((((((((((((((.....(((.(((({(({{(,|..,,,,.,,....(({..((({..(((((.....)))))))))))).............,}}.,)))..............((((....((...(((({..........,.)))))...))...)))))})......,))))),,)))))))){{{{{.,||,...,.,)),})),,.))))))))))))))........,..(((((((((((((((.((((({.,(((((({...,,((,.....|||,((({((((,(({.(((((((,.((..((((((({((.,...,..,((({{,,,.{{|}||{{..,..((((({{{{{,||||,{(,,.,((({,((((({..{((({(((,{({{.{{{.(((,....|||}|||||((.|||,.})))}))}}))}},)})})))),}}}.)))|)},||||,....}}}}..,,},}}|||,,..........},,,|||,|,,,||||||}}||.,,,..(((((..(((((.{((((((.......(((((..(((((..(((((((((((((((((({{{,.....(((((((.(((...)))))))))),.(((((.(((....))).))))).{((.......))|(((((.......))))),......,}}}},,.((((((((((((((((((..,,,,{{,,{....{(({{,.,,{{.|||||..{{{{{{,...,.,..,(,{{{{,,,((({(({,(((((((....(((..(((((((...{.((((((((((((...)))))))))))).,.......)))))))..)))....))).))))))))))))}},|||.,...,|,|||}|,|{{((({{......(((((((((.....((((((((((((((((.{....|{.(((((({.{(((.,{..(((((.(((({,((((((((..{(({({,,.((((((....))))))...)),}.))((((((((((((((((.(.(((((...,(,...........),,)..))))).)))))).....{((((((((((......(((((..(((((...((((....)))))))))..)))))...)).))))))))}{{.{{..(((((.((((,{((((((((((((.,((,,....))),,,}}},},,.)))))))))))).)))))..}}.}}.{(((((.....)))))|(((({{{{{.,,...,.,,,....,.((((((...(((((.......)))))..))))))}...,...,}))),{|||||}},{{{|||||}....((({...}))}{{..,,,...}}...,,,......{(((((((((({...(({{(((...)))))}((((((...)))))))))))))))))),)))))))).)))))))))))..(((((((((((((......((((((((((....))))))))))))))))))}....))))))..))))))))))))).))))).,,)}}}.,{(((((,({(((((({.......((((((((((((......((((((((((..((((({....})))))((((((((((...............(((((.((((,{{.(((,((((((.,...((((((.((((.(((((((...,,..((((((...,.(((((((..((((((......((((.((.........))..))))......)))))){(,(,(((({{.,,.{{{{.,..,)))).,||||||}.}.},...,,,,,,....)))))))....))))))..},.......))))))))).)).)))))).....)))})}.)))})))))))))))))))))))))))))).)))))(((((.((((.{(...({.(((((((.(((.((((.......))}),..))).))))))))}....)}..)))))))))))))))}},))))).,,.)}}}.}})}}}},,}}..,}},))})})))}))})){..((((((((....))))))))..}.,.......,,}}.))))}})))))).))))).....))))))))).....)))})},...,,........}}}},...)))),|||,,,,,..,})))))....))))))))))))))))).....{{{........)))..,,,,,,.,))))))))))))))))).)))))..)))))..|,,.....(((((((........)))))))..))))))).,.(((((((..(((...))),.))))))).}))))..)))))..,{{{{.........))))))))}..))}.}.,,))))}.)))))))}|||,,|||}}}}....,)),.,))))}}}}..(((((,{(((((.(((((.(((((..((((((((.,...((((((....))))))..))))))))(((.{(((((((....)))))))}.))).....(((((....((((((((((..((...)).))))))))))..)))))....,{{{,{((((((((........)))))))).,,..}}}|(((((..,,......))))),.......))))).))))).)))))))))))...{{{.....))}}))))))))))))))....))))))))))))).((((.(.((((......)))).).)))),|}|||}}}.,,{((({|,.........,,,.,}|.}}}))..})},))))),}}||||}}}},.............{{{.(((((..(((((((((((..........)))))))))))...))))),)),......,,......}))))))),,}}.}))))).})))}}..,,,,}}.))))))))))..))){{{{.,(((((((((((.............))))))))))),)}}}(((((((.....)))))))....((.(((((((.....))))))).)).)))))))....)))))))}))))))..)))))....)))))))))).)))))).(((((((..((......))..)))))))......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001161725.2 NCBI
GCCGCCGUGGCUGCCGCAGCCUCUGGGAGUCUGGAAAAGGGGAAGCGAG… 4558 nt 0.4208
NM_001161726.2 NCBI
GCCGCCGUGGCUGCCGCAGCCUCUGGGAGUCUGGAAAAGGGGAAGCGAG… 4513 nt 0.4170
NM_001352912.1 NCBI
CUCAUGUGGGAGUUUGUCUUUUUUUUUUUAAACUAAAAUGGAGGCUGGU… 4270 nt 0.4037
NM_001352913.2 NCBI
GCCGCCGUGGCUGCCGCAGCCUCUGGGAGUCUGGAAAAGGGGAAGCGAG… 4630 nt 0.4186
NM_001352914.2 NCBI
AAAAGCUGCGGAGGGCGGGACCAACCAGGAAAGGACGGGACUGUCGGGU… 4455 nt 0.4101
NM_001352915.2 NCBI
AGCGAGAAGGGACCCCGCUGAGAGCUGGAAUCACCAAAAGCAGGGAAGA… 4279 nt 0.4043
NM_001352916.2 NCBI
AGUUCCCUCCAGCUGCAGAGAGCUUCAGUUUGUCUUUUUUUUUUUAAAC… 4375 nt 0.4066
NM_002719.4 NCBI
AGUUCCCUCCAGCUGCAGAGAGCUUCAGUUUGUCUUUUUUUUUUUAAAC… 4388 nt 0.4066
NM_178586.3 NCBI
AGUUCCCUCCAGCUGCAGAGAGCUUCAGUUUGUCUUUUUUUUUUUAAAC… 4271 nt 0.4046
NM_178587.3 NCBI
AGUUCCCUCCAGCUGCAGAGAGCUUCAGUUUGUCUUUUUUUUUUUAAAC… 1586 nt 0.4061
Summary

The product of this gene belongs to the phosphatase 2A regulatory subunit B family. Protein phosphatase 2A is one of the four major Ser/Thr phosphatases, and it is implicated in the negative control of cell growth and division. It consists of a common heteromeric core enzyme, which is composed of a catalytic subunit and a constant regulatory subunit, that associates with a variety of regulatory subunits. The B regulatory subunit might modulate substrate selectivity and catalytic activity. This gene encodes a gamma isoform of the regulatory subunit B56 subfamily. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.