Basic Information

Symbol
ATG101
RNA class
mRNA
Alias
Autophagy Related 101 C12orf44 Autophagy-Related Protein 101 FLJ11773 Chromosome 12 Open Reading Frame 44 Atg13-Interacting Protein
Location (GRCh38)
12:52069246-52077495
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021934.5
Sequence length
1433.0 nt
GC content
0.5967

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-626.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -648.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 443.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001098673.2 NCBI
CCGGUCCCGGCUCAGCCUCCGACCCAGGUGGUCUGGAGCCUGCCGGGAG… 1262 nt 0.5816
NM_021934.5 NCBI
CCGGUCCCGGCUCAGCCUCCGACCCAGGUGGUCUGGAGCCUGCCGGGAG… 1433 nt 0.5967
Summary

Enables identical protein binding activity. Involved in autophagosome assembly and negative regulation of cell population proliferation. Located in phagophore assembly site. Part of Atg1/ULK1 kinase complex. Biomarker of cholangiocarcinoma; colon cancer; and hepatocellular carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.