Basic Information

Symbol
PPP6R3
RNA class
mRNA
Alias
Protein Phosphatase 6 Regulatory Subunit 3 PP6R3 SAPL KIAA1558 C11orf23 SAP190 SAPLa SAPS3 Serine/Threonine-Protein Phosphatase 6 Regulatory Subunit 3 Sporulation-Induced Transcript 4-Associated Protein SAPL SAPS Domain Family, Member 3 DKFZp781E17107 DKFZp781E2374 DKFZp781O2362 MGC125711 MGC125712 FLJ11058 FLJ43065 Sporulation-Induced Transcript 4-Associated Protein Protein Phosphatase 6, Regulatory Subunit 3 Chromosome 11 Open Reading Frame 23 SAPS Domain Family Member 3
Location (GRCh38)
11:68460475-68615343
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164161.2
Sequence length
5072.0 nt
GC content
0.4213

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1459.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1556.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1333.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164160.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5090 nt 0.4212
NM_001164161.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5072 nt 0.4213
NM_001164162.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5054 nt 0.4214
NM_001164163.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 4985 nt 0.4221
NM_001164164.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 3371 nt 0.4607
NM_001352347.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5018 nt 0.4229
NM_001352348.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5250 nt 0.4217
NM_001352350.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5003 nt 0.4219
NM_001352351.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 4788 nt 0.4246
NM_001352352.2 NCBI
GGGCGCUUCGCUGAUGGUGUCGGUGAGCGCGUUUCCCGCCUGAGCGCAA… 5039 nt 0.4217
Showing 1 to 10 of 39 entries
Summary

Protein phosphatase regulatory subunits, such as SAPS3, modulate the activity of protein phosphatase catalytic subunits by restricting substrate specificity, recruiting substrates, and determining the intracellular localization of the holoenzyme. SAPS3 is a regulatory subunit for the protein phosphatase-6 catalytic subunit (PPP6C; MIM 612725) (Stefansson and Brautigan, 2006 [PubMed 16769727]).[supplied by OMIM, Nov 2010]

Forensic Context

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