Basic Information

Symbol
PREB
RNA class
mRNA
Alias
Prolactin Regulatory Element Binding SEC12 Prolactin Regulatory Element-Binding Protein Guanine Nucleotide-Exchange Factor SEC12 Mammalian Guanine Nucleotide Exchange Factor MSec12
Location (GRCh38)
2:27130752-27134671
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013388.6
Sequence length
2127.0 nt
GC content
0.5816

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-870.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -911.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 580.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330484.2 NCBI
AGUGCGCGUCUGCGAGACCGACUUGGACGGAGCCGAGCUGAGGCUCGGC… 2060 nt 0.5830
NM_001330485.2 NCBI
AGUGCGCGUCUGCGAGACCGACUUGGACGGAGCCGAGCUGAGGCUCGGC… 1953 nt 0.5786
NM_001330486.2 NCBI
AGUGCGCGUCUGCGAGACCGACUUGGACGGAGCCGAGCUGAGGCUCGGC… 1967 nt 0.5811
NM_001330487.2 NCBI
AGUGCGCGUCUGCGAGACCGACUUGGACGGAGCCGAGCUGAGGCUCGGC… 1793 nt 0.5778
NM_013388.6 NCBI
AGUGCGCGUCUGCGAGACCGACUUGGACGGAGCCGAGCUGAGGCUCGGC… 2127 nt 0.5816
Summary

This gene encodes a protein that specifically binds to a Pit1-binding element of the prolactin (PRL) promoter. This protein may act as a transcriptional regulator and is thought to be involved in some of the developmental abnormalities observed in patients with partial trisomy 2p. This gene overlaps the abhydrolase domain containing 1 (ABHD1) gene on the opposite strand. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the PREB in microglia, where it is involved in the protein processing of endoplasmic reticulum pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].