Basic Information

Symbol
PRELID2
RNA class
mRNA
Alias
PRELI Domain Containing 2 PRELI Domain-Containing Protein 2 MGC21644 FLJ38376 CTC-806A22.1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_205846.3
Sequence length
4817.0 nt
GC content
0.3978

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1413.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1504.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1356.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((((((.((..((((((.((((((.(((...(((.((((((....))).))))))))).)))))))))))).)).))))).(((((..((.((((..(((((((...)))))))..))))..((((((.((.(((...))).))..)).))))))..))))).((((((((.......((......)).......)))))).)).....((((((((((..((((((((..(((.......(((((((((..((((((......((((((((....((((..(((((...................(((((.....))))).......((((((..((..(((...)))..))..))))))...(((((.((....((((.((((((..((...))..))))))))))..)).))))))))))..))))...)))))...))).....)))))).............(((((((((((...((((((((........)))..))))).....)))).))))))).))).)))))).......)))))))...((((((..(((((((((((((.((((((((.((..((......))..)).)))))(((........))).(((((((((((((((((((.(((((((................((((((((((((......((((....)).)).....(((((.((((((.((((....)))).)))).)).)))))(((((((((((((((.......))))).((((((((((((.........((((.(((((..((((((......)))))).)))))))))(((((((((((((...((.(((((((.(((((((((((((....(((((....)))))....))))).........))).)))))(((((.....)))))(((((..((((((((((((......)))).)))))))))))))...)))))))))..)))))))).)))))....))))))).(((((.((.(((((((.(((((((......))))))))))))....)).)).))))).)))))(((((.....)))))((.((((.(((........))).)))).)).....)))))))..)))....................))))))))))))..((((........))))....))))))))))))((((.....((((((..((((..(((((..((.(((((...((((((..((..((((((((......((((((..(((((((((((((((((((((((((.((((((((((..(((..((.((((((....(((((.((((.(((((((.....(((((((((((.(((((((..((((((.(((((((.(((((....)))...((.(((((.((((..(((......)))....)))).))))).)))).))))))).))))))))))..(((....)))))).)))))))))))(((((..((..((((((((((..((((((((((((.........(((((.(.......).))))).........)))))))..)))))..))))))))))..))..)))))(((((((.(((...((.....((((((((((...((((.....)))).....))))))))))...))...)))..)))))))......(((..(((..(((((..(((((((((............)))))))))...)))))..)))...))).......................................))))))))))).)))))...)))))).))...)))..((((..((((((((....(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((..((((((((((((((((((((((((((..((((((((((.((((.(((((......................((((((.(((((((((((..(((((((((...(((.((((((....(.((((((.....)))))).).)))))).)))...))))))))........)..)))))))))))..))))))....((((..(((.....)))..))))((((((((((((((((((((((((...(((((((((.((((......(((((((((((((.............))))))))))))).....)))).))))(((((((.((((..((((((......))))))(((((((((((((((...((((...........)))).......((((...(((.((........)).)))....))))))))))))........(((((((...)))))))(((((((....(((.(((............))).)))...)))))))....(((.....)))...)))))))((((((((((......))))))))))........((((.((..((((((..((((.(((((((.((((...........((((((.(((((((((((.........((((.((((((...((((((...(((....)))..))))))......((((((((((((((.((((((((.((((((.(((.(..((..(((((((((.((((.((.((...(((................))))).)))))).)))))))))..))..).))).)))))).)))))))).))))))))))))))..(((....))).......((.....(((((.........((((((((.(((((...(((((((((((((((((((((......)))).......(((((((((.(((((((((((((..(((((.((...)).))))).))))))........((((((.....))))))..))))))))))))))))..))))..))))))))............)))))))))).)))))))).....((((((..(((((...)))))..))))))(((.(((((((((.((((((..(((((.......))))))))))))))).))))).))).)))))..)).)))))).))))...((((..........))))..)))))))))(((((((((((.........)))))))))))....)).))))))..(((((((....)))))))....))))))).))))))))..))))))((((((((((((((...........)))))).....))))).))).(((....)))....)).)))).......)))).)))))))...))))))))))))))))))))).......))))))))))))).)))).))))))))))..))))))))))))))))))))))))))....)))))).)))))))).......))))))))))))))))))))))))))).)))))))))...))))))))..)))).))))))....((((((.(.(((.((((...((((((.....)))))))))).))).).)))))).............((((((((((............((((...((.((((.(((((......(((.............(((.(((....(((((........)))))..))).)))))))))))))))..))...))))....(((((((((..(.((.(((.((((...(((((.((.((((((.(((.(((......))).)))............)))))).)))))))...)))))))..)).)..)))))..))))))))))))))..........)))))))))))))).........((((.((((((((((((((.(((((.....))))).))).........))))))))))).))))((((((((........))))))))((((((.(((.....))).))))))....(((((.((((.((((((......))))))))))))))).(((((.(((..((((((((...)))).))))....))))))))..)))))))))))...)))).)))))).......((((..........))))...........(((....)))....(((....))).((((......))))))))))))))))))))))))).))..)))))...))))..)))))).....)))).((((...........))))...))))))...)))))))))))))).)))))))))).............)))))).........)))).)))))))))).........)))))))))))..((((((..((((..(((((((...(((((.(.((((.(((((((((((((((.(((.....)))..))))((((((((..(((..(((((..(((((...((..((((((................))))))((((((..((((...))))..))))))))....))))).......)))))..)))...)))))).)))))))))).))))))).).)))))..)))))))))))....)))(((((...)))))...((.((((.....)))))))))..((((((((.(((...((((((...((((((((........)))......(((........)))....((((((((((...((((((...(((((.((((......((((((.(((.((((......)))).)))...))))))...)))))))))))))))....))))..)))))))))))))))))))).)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((((((((.((..((((((.((((((.(((...(((.((,((({...}))}))))))))).)))))))))))).)).))))).(((((,.{{,((((,.(((((((...)))))))..}||}..({{(((.{({({{...)),,))}.)},,)))}),.)}|||,((((({((,,.,,,,((,,,,{{|,.{{{{{.||||||,||.....{{(((((({(,.,,,{{{{||,|||.,,{..,{{{{{{{{{..|||||{,,,...{{{|||||....{||||.{|{{{|||,.||,,,,,....,,|{{,,,.,,,.,}}}}....}|,((((((..((..(((...)))..))..))))))...,{(((,((.,,,((((.((((((..({...})..))))))}}}|,.||.||||||||||{.|,,....}}}},..,}},..,,||}}}}},|},.,||...|||||||||||||.,.{((({,{{,{{{,...,,}.,}||||{,,|,||},.})))}}}}}))},}}},...{{{{|{|,|||,.(,((((({,.(((((((((({{(.{{,(((((.((..((......}}..}).))))){,{.,..{{{{|,.{(((((((((((((((((((.(((((((..,.............((((((((((((......{(((....}}.}|...,,(((((.((((((.((((....)))).)))).}).))))|((((((((((({(((.{.....}))))}((((((((((({.........((((.(((((..((((((......)))))).))))))))).........(((((((((.(((((.,.......{{,((((((..........))))))),..})))).))).)))))),,|},{{((((({,,,({((,{(((((((((((((((((((,.....)))))))))))),.)).))))))...,.))))).)))))))).,}},...))))))).(((((.((.(((((((.(((((((......)))))))))))}.,,,}}.)).))))).)))))(((((.....)))))((.((((.(((........))).)))).))....})))))))..))),,............,.....)))))))))))}..((((........))))....))))))))))))((((.....((((((..((({..(((((..{{{(((({...{{((({.,|{..((((((({|.....,,,{(({{(({{{{{({{{((((((((((({{{{(((({,,,,,,,({{..((.((((({....(((((.{((,,(((((((||||{{{{{{{(({,,,{||((({..((((((.(((((((.{{{((,...))},..{{.({{({,{{{,..{{{,...,.}))..,.)}}}.,|||}.,,)),))))))).))))))))))..||{{{{{||,,,..,))),))))||{((((,.{{..((((((((((..((({((((((((..,,...,.(((((.,.......}.))))).},..,},.)))))))}.,})))..))))))))))..))..||,|{(((((((.(((...{{.....((((((((((...((((.....)))).....))))))))))...}}...)))..))))))))}.,..(({..(((..(((((..(((((((((............)))))))))...)))))..))).,,))}........................,,},,,,,},.....))))))))))).)))))...)))))).))..,))),.((((..((((((((...,(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((,((((((((.((((((..((((((((((((((((((((((((((..((((((((((.((((.(((((....{{{{,...........,,((((((.(((((((((((..(((((((,({{.(((.((({{(,,{.,.((((((.....)))))).),)))))).)))..,))))))))........}..))))))))))).,)))))).,,.((((..(((.....)))..))))..,,{{{{((((((((((((((({...((((((({{.((((,{{...(((((((((((((.............))))))))))))),,,..)))).}}}}(((((((.((((...(((((......))))){((((((((..{{{{({(...,{,.,.......,((((.({.((.((((...(((.,{........}}.)))....))))..)).)).)}}}},..(((((((...)))))))(((((((.,{.(((.(({............))).))),}.))))))).....,.,}}.}))},.))))))))}|(((((((({{{{{.|||||,,,.,,,,,...,(,((,((..{(((((..(({(({((((((,((((,,{{((.,,,(((((((,({{{((({{{{..,.,,,,.||||,|{{{{|,,.((((((...(((....)))..))))))......((((((((((({((.((((((((.((((((.(((.,..{{..(((((((((.((((,({,((.{{(,{...........}}}.,)),)),}.)))).)))))))))..}}....})).)))))).)))))))).))})))))))))))..{{({{,{|}|,,,,,{{(({,.,.({{{{.,|||||,,{,{{{{{{.{{|||.,.|||||||{(({(((({{{|{|,.,,,.||||,......(((((((((.(((((((((((((..(((((.({...}).))))).))))))......,.((({{,.....}))))),.))))))))))))))))..}}}}..))))}}||,,{,..}}}}},}}}}}}}}}}.}}}}}}}}....,{(((({..(((((...)))))..}))))}{{{.{((((((((.((((((..(((((.......))))))))))))))).))))}.|}|,||||,...}})))}))|))))...((((..........))))..})))))))}{{{{(((({{{.,},.,,},))))))))))),...))})))))}},|{{{{{,.,,,}}))))},}},))}})))..}}}})))..))))}}((((((((((((((...........)))))).....))))).))).,||}}}}))},))}),.,,,,.......)))).))))))).,,)))))})))))))))))))))..,,,..})))),..))))).)))).))))))))))..))))))))))))))))))))))))))....)))))).)))))))).}.....))))))))))))))))))))))))))).))))))))),..))))))))..))))|||||||,.,,((((((.{,(({.,{{{.,.{{((((,,,,,|}}}}))))),)}}.).))))))..,......,,,.((((((((((..{{,..{{,..((({,..(({,((({.{(((,{{.{{{||,.,,|,.,.....,{{,|(({{,{((({{...,,,..|}|||{,}}|{||,.|.|||},,,,,.})),,.,))},..,||{((((,{....{{.,||,|{((..,((((,,{{,||||{{,{((.(((......))).)))......},,,}})))))).))})))),,,)}))),,..},.,,}))))}}})))))))))))))}.,,,......)))))))))))))).,||....,((((.((((((((((((((.(((((.....))))).))).........))))))))))).))))((((((((,.......)))))))}{({(((.{((..,,.))}.}))))}.,,.(((((.((((.((((((......))))))))))))))).{|||{.{{|,,{{{|{||{,.,)))}.)))}....})}))))),.)))))))}))))}})))).,,,,,........{{{{..........}))},..,.......(((....)))....{{|,.,,)))||({{......})}))))))))),))))))))))))},,..)))))...})))..)))))).....)))}.|{||||,.....,.,)))},..))))))...)))))))))})))).)))))))))).|||,....,}}.})))))}.......})))),,,,,}}}}}},,,......))))))))))),.({{{((..{,{(|.{((((({.,,{({((.(.(((,{(((((((((({|{{{.{{(,....}}},.}}}|{{((((((..(((.,(((({..((((({.,(,,.,(((,{,..,,{{,{,{{{{,,..||,,,,,,|,..,|||.,})))),,),,)),))}.},))))),,.....}})))..)))...)))))).}})))))))).))))})).).)))))..)))))))}))).}.,))){{{{,...,)))),..|{.|{{{.....))))}}})),.((((((((,((({.{(((((.{{.(((({,{,.......})))}}.}}}|||.}}}},..}||,...((((((((((...,{{(((,..(((((.((((......((((((.(((.{(((......))),.)))...))))))...)))))))))))))},....))))..)))))),))),,,,.,,,},.)))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GAGUGUGGGCGCCUCCGGGCCUCUGCGGAGCCCUGGGCAGCUCUGAGCU… 5020 nt 0.4010
GAGUGUGGGCGCCUCCGGGCCUCUGCGGAGCCCUGGGCAGCUCUGAGCU… 4853 nt 0.3977
GAGUGUGGGCGCCUCCGGGCCUCUGCGGAGCCCUGGGCAGCUCUGAGCU… 4817 nt 0.3978
Summary

Predicted to enable phosphatidic acid transfer activity. Predicted to be involved in phospholipid transport. Predicted to be active in mitochondrial intermembrane space. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.