Basic Information

Symbol
PREP
RNA class
mRNA
Alias
Prolyl Endopeptidase Post-Proline Cleaving Enzyme Prolyl Oligopeptidase EC 3.4.21.26 PEP PE DJ355L5.1 (Prolyl Endopeptidase)
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_002726.5
Sequence length
7250.0 nt
GC content
0.4434

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2175.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2315.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2077.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((.((((.((((((((((.((((((.(((((((.(.((((((((....(((.((((((.((.....)).)))))))))((((((((((((((((((...((((((...))))))......)))....(((((((((((...((..(((....((((((((((((...(((((((((((.(((...(((((......)))))..)))...(((((.(((.......))).)))))(((.(((((.((((((((...))))))))....(((.((((((((..((((((((((((....((((..((((((....)))))).(((((((((.((((((.((.((((((((..((((......(((..((((...........))))..)))((((((((...........))))))))..))))))))))))))...)))))).))))))))).........(((((...)))))...(((.......((.(((((.((((((((..(((((((((((((((((.(((..((..........(((....)))))..))).)))))))(.((((((((((((((.(......).)))))...((((((..(((((((((.......)))))))))))))))..(((((.((.....)).)))))((.((......))..))((.((.((((((.....)))))).)).))))))))))).).((((...)))).((((.(((..........))).))))((((((((((((..((((.(.((((((((((((....(((.(((((((....(((((((((.(((((((..((((((...(((((((.(((....))).)).))))))))))).)))........))))...)))))))))(((((((.(((.(((.((..((.(.(((((((...))))))).).))..)).)))((((..((((....))))))))..((((((..(((((.(((.(((....))).))).)))))..))))))...(((.(.((((((((((((.(((((((.(((.(((((((....((.(((((((((((((...........))).)))).))))))))....))))))).))).......(((((((...))))))).((((((...((..(((((((.....(((.((((((.((.((((((((((((((((((((((((....(((((((...(((((.............((((((....((((.((((((((((.(((.((((...((((((((((((((....(.((..((..((((((((.(((..(((((((((((((...((....((((((((.(((((.........))))).....))))))))....)).((((((((........))))...)))).(((((.(((((((....((((((.(((((...(((.(((((...((((((...(((((((.....)))).)))...)))))).)))(((....)))...((((((.((.........)).))))))........)))))....))))).))))))..))))))))))))..((((.((((..........)))).))))..((((((......(((((((((((......)))).))))))).))))))))))))).))))))))).))))).)))..)).)))......))))))...((((...(((((...))))).))))..........(((((((..(((((((..((.((((((((((((((((((((.(...(((..........(((((.((((((.((((.((((((.((((.......(((.......)))(((....)))(((((((((.......)))))))))(((((((((((((...))).))))).)))))..)))).)))))).)))).....))))))...)))))))).))))))..)))))))))).))))).)).(((...(((((((...((.....))...))))).))...))))))))))...)))))))....)).))))))(((((((....(((((((..((((.(.((((((((((...(((((...((((((.....)))))).....)))))......)).)))))))).).)))).))).))))(((((......))))).....(((((.(.((.....)))))))))))))))......(((.......)))...((((((((.((((.(((...(((((.....)))))))).))))(((..(((((...........)))))..)))))))))))((((((..((((((......((((((............((((((((((((((((((((.((((((.(((((...))))))))))).))(((.((.(((((...(((((......)))))..(((((((.............((((((...((....))..))))))...........))))))))))))..))))))).))))))))))))))))........(((((.(...((((.(((((((....(((((((((((..((((((......((((((((((((((((((.((((..((......................)).))))))))))))......((((((..(((((((((..((((((((((.................(((((((....))))))).......(((((.((((((((((...))))))..))))...)))))))))))))))))))))))).....))))))((..((......))..))..))).)))))))...))))))..)))))))).))).........))))))).))))...))))))))))))....)))))))))))))))).))).))))).)))))...))))..))))))...........)))))...)))))))......((((((((((((......((((((((((...(((.((((........))))..)))..))))))))))........((((((.((......)).))))))....)))))))..)))))(.((((((((.(((((....))))).)))))).)).)))))))))....))))))......((.((((((((((......((((((.......)))))).(((((((((((((((((((((((......(((.......))).....)))))..........((((((..((((...........((((((((((...........))))))))))(((((((((.....((((..........................))))..)))))))))......(((......)))))))..)))))).))))))))))))))))))...((((......))))..................(((((((.......)))))))......((((((((((((..........))))))))))))((((..(((((.((((.............(((((........)))))))))...)))))..)))).)))))))))).)).)))))))).)))).)))))).))).......)))).)))..)).....)))))).....))))))).))))(((......)))..(((((((((((.(........).)))).))))))).((((......))))..((((...((((.(((....))))))).)))).....)))))))).).))).......)))..)))))))..((((..(((...))).))))(((((((((((.....(((((......................))))).....)))))))))))....(.((((....(((((..((((.((((((((((........(((((..((.(((((.((..(((((...)))))...)).))))))).))))).((((...))))....(((((((((((((((....((((.((....(((.(((.(((((((....(((..((((((........((((((....))))))......)))))))))))))))).))).)))..)).)))))))))))).............))))))).......(((((.(((((((.................((((((((((.(((((((((...))))))).(((((((((.............(((((((..........)))))))...(((.(((((((.......)))......)))).))))))))))))...(((((.((((.((((((((((.(((((......)))))..)))...((((((...........))))))((......))...((((((.........(((((.......................))))).........))))))(((((((..(((..............)))))))))).....))))))).)))).)).))).....))))))))))))))))))).))))).))))).)))))))))...)))))....)))).))))))))...)))......)))))..)))))))).))))..............(((((...)))))))))))).)))))..((..((((.(((((....)))))..)))).))...........((..((((.((((((((.((.(((((((..((.((((.((((.(((((((((...(((......))).......(((.(((((..((.((...)).))..))))).))).((((((((.....))))).)))..((((...((.((((........)))).)).)))).))))).)))))))))))).........(((((((...)))))))....))..))))))).)).))))))))))))..))))))))))))((((((...))))))..(((((((.....((((...))))....))))))).....(((((.(((...........))))))))...(((((............)))))........((...((((.....(((.....((((((.((((.(...........).))))..)))))).....)))))))...)).)))))))).))))))).......)))....((((((..(((((((((((((((..((((.(((((..(((...(((((..((((......(((((.....)))))...))))))))).)).)..)))))..)))).)))))))))..)))))).)))))))))).))))))))))))..)))))))))))((((((((.((..(((((((((.((((((....((((.....)))))))))).....)))))))))..))..((((.((.......))))))))))))))...))))).))).(((.((..((((..(((((((............))))))))))).)).)))(((...)))....((((.((((((....)))))).))))........(((((............)))))((.((((((...((........))...)))))).)).)))))))))))((((((...(((((.((...))))))).))))))(((((...........)))))......(((((((((((((.(((((((((.(((.(((.....)))))).))))..)))))...)))))))...))))))..((((((.((..(((((....(((((((.......((......)).......)))))))(((((((((......))).)))))).((......)).....((((.(((((((.......(((((.((((((((..((..(((((((((.(((((((((((((((((......(((....)))......))))))...((((((.........))))))(((((..(((((.(.(((((.(((........((((((............(((......))).....((((((...)))))).(((((.(((((((((((((.........))))))).((((.((((((......))))))..)))).((.(......).))..)))))).))))).......((((.(((.(((((.((((((....((((....((.......))))))..))))))...))).)).)))))))..(((((((.(((...))))))))))(((.(((((.(((..(((((.(.(((((.....((((.....))))....((..((((((.(((..((.(((((.....(((((..((.(((((......))))).))...((.((((((...)))))))).....((((............))))...........))))).........))))).))...)))...))))))..))))))).).))))))))))))).)))....))))))((((........)))).)))...))))).).))))).)))))...))))))))))..).)))))..........))))..)))))))))))))))))))))).))))...)))))..))))))))...))))))))))))....)))..)).)))).)))))))((......)).......))))))))((((((..(((...)))))))))..................)))))))...(((....))).)))).)))).)..))))))).))))..............(((((((..((((((((((....)))))))))).)))))))(((.((((((..((((...(((((..((((((((...((((..((((............))))..)))).......(((.((....)).)))))))).))))))))..)))).....(((....)))..(((((((....)))))))........)))))).))))).).))))))))).)))))))....((((((.(((.......(((...((((((.((.(((...((((.....((((.....)))))))).)))))...)))))).((((.(((....)))))))...(((((((.......)))))))...((((((((....))))))))....)))........))).))))))................)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.{({.((((.(((((((({(,((({(({({{{((((,(((((((((((((((({,,|{({|((..(({({{{(,{({,{{,{{{{,||,|||,|||,,.,,||||||,,}))))))}})...)))}}}},||||(((({{..}||,{(((.{{((((({{,,((((({{(((((,,.((((,((({.(((((({,,,{((({..{{{....(((((.(((.......))).)))))(((.(((((.((((((({...})))))))....((,{((((((((..((((((((((((....((((..((((((....)))))).{((((((((.((((((.((.((((((((..((((.....,(((..((((...........))))..)))|(((((((...........)))))))},.))))))))))))))...)))))).))))))))}.........(((((...})))).,.(((.|{,...((.(((((.{(((((((..((((((((((((({{{({(((..,({{{.{{,...(((((,....|((.((.(((((((({{((((.,.,.(((((.(.....,).))))).....)))}.,}|,|.|))))))).))))))))))}}|||,|{.{((((.((.....}).))))){|,{({,.,,,(({..{{{.{(.((((((.....)))))).)),))}}.}))))),},||||.,.}))).((((.(((..........))).))))((((((((((((,.((((.(.((((((((((((....(((.((((((({,..(((((((((.(((((((,,((((({...(((((((,((,....))),}}.))))))})))),)),,..,....)))).,.))))))))),.((((((,,,,||||||.,,..,,||{{|||,,,}|||||((({({((((((((((((,.{(({....})))))))..((((((..(((((.(((.(((....))).))).)))))..))))))....,..,..,{{((((((((,,((((((,(((.(((((((....((.(((((((((((((...........))).)))).))))))))....))))))).))}.......(((((((...))))))).,,(((({(((,.(((,,((({{.,{(((((((({{.{(,{((({{{{.,{((({{((,{{{{{{{{{{{,,,.,{|||||,||||{|}},..,,}||||{||},,|||,.,{{({(((({.({{.{{(({{{{,{{|{{{(((({{.,,.,.{(,.((,.((((((((.{((..{{{{(((((((((.,.((,.|,((((((((.(((((.........))))).....)))))))}....}}.((((((((........)))),..}))).{{{{||{((((((,...((((((.(((((..,(((,{{.,...{((({{{...{{{((((.....)))),||}.,,||||||,|{{(({.,,.|||.,|(({{((|{(|....,,.})).||||||........})))),,..}}))|.|})))),.))))))|||||}.,(({(,({((,,{,,,.|..}}}}.}}}}..((((((......(((((((((({......}))).))))))).))))))))))))||}}}}}|})).}))}}.|||{.||,|||,...|,||||||..,{({(,,.,{{{||,,}}}||{}}}|,|,,,,,,..{{({((((.(((((({{,((,((((((((((((((((((((.((.,(((.....}}}},||((((((((,.(((((..{((,,,{||},}}}).)))))))),||||.(((....))},{(((({{{..,,,..))))}))}}(((((((((((({...})).)))))}}))))|||||,,..,,,...........}}||||{..,,))).)).,)))))..)))))))))).))))).,}.,||},.{|{{{{{..,||,,...,),,,))))}.|}...}}}}}}}}}}.,,},|||||.{{{....|||||,,,,|,..|||||{{{{|,.||||,(,((((({{{{{.,,|||||,..((((((.....))))))....,))))),},,}.)}.}})}))}).},))}),)))}.)),,{||{....,,|}}},.,((.(((((.{.({.....))))))))))}}|||||||||{...}},,.,}},,,,{|||||||.((((.(((...((((,....,)))},))).))))(((..(((((...........)))))..)))|||||||}(((((({{..((,...{{{{{..(({....))).....((((((((((((((((,(((.((((((.(((((...))))))))))).))|((.{{.(((((...(((((......)))))..(((((((.............((((((...{{....))..)))))).,,.}......))))))))))))..}}))},,.)))))))))))))))).....{(((((,{.{..,((((.(((((((....(((((((((((..((((((...,{.((((((({{,{(((((((.((((..((,......,.....,,,,,....}}.)))))))))))}......((((((,.,,||||||||,{(((({((,{{{{{,{...........(((({({....})}}}}|{{,{{{{{((((.(({(((((({...})))))}.||||||.}}}}))))))},}))))|)||}},..,,.))))}}.,..,|}},...))..))}}))).))))))).,.))))))..)))))))).))).........))))))).)))).,.,}},..)))))).,,,,,,,,,.,,,,))))).,)).,))))})))))}}}))}},.|||}}..,}}},..)}),,))))))})}|||||||,||||||{,||,,(((((,..{{{{{{|||.,,,,}}.})}}...,))),,}}}))}}}.,,,))}}}}}.,}.}}}}}{(((((.{(......}}.)))))},}}}}}}}.....))})}}}|,((((((.(((((....))))).)))))).))})))}}||},....,,}},,......,,|{{{||,,|||,...,.{{{{{(.......})}}},.(((((((((((((((((({((((,,....,{{.......}})},...})))},|||...,,,((((((..((({..........,((((((((((...........))))))))))|((((((({...,.((((,{,....................,,.)))).}))))))))},.....,,{......)))))))..)))))).})))))))))))))))))...,|||......}}},..,,,,,}}}}}},.,}}||{{{{|,,,|,..||||}},.....,((((((((((((..........,)))))))))))|{{{..{{({{,{{,|.,,,......,.,,,,|}|||||,,,,}}}}}}|},,.,})))..})))}))}}|||}}}((((({....))))))..,,,},}.,}}....,,,|||||{{{{({|.....,|||||,.....,,,}}},,,.,(((......}))..(((((((((((.{........}.))))}}))))))........||||}||,.|{{|.,,||{{{(((....)))))}},||||.||,|||||||,..|((({.....))))),,}}}}}},..,{||,.,|,.{{|}|{|||{(((((((((((,....(((((,...,{,.{,...,,.,}....)))))....,))))))))))),,.,})))|,.,,}(((((.,((((.(({{((({{(.........,{{{.,({.(((((.{(..(((((...)))))...}}.)))))))}))})|||{||,,|||}}.,,.{{{(({((((((((,...,((((.((..,,((,.(((.(((((((....(((..((((((...,....((((((....))))))......)))))))))))))))).))).))),.)).)))))))))))),..,......,..})))})).......{{((({({((((({................((((((((({,({(((((((...))))))).((((((((({{..,..,,,,..,{{{(((,,,.......)}}})))...,,..,{{{(((.......)))...,})))}},,})))))))))}...{{{,{.((((.{((((({(((.{((((......)))))..)))...((((({,..........)))))),,......},...((((((....,....{((((.........||............}))))....,....)))))){({{{{{..{{,.....,,,......,},})})))}....,))))))).)))).,,.))).....}))))))))))),,}))}).))))))))))),)})))}))}...}})))...,}}.}}.)))))))...)))......)))))..)))))))}.))))...,,,........{{(({...}))})))))))).))))),,{,...,},)))|||}}}{{|{........))))..........((..((((.((((((((.((.(((((((..{,,(((({((,,.,||||||||..{(((,,{{.{|||,,,,,..(((,({(((,.{{.{|}.,)),))|.}}}||{||,.((((((((.....))))).)))..}|||}..|,..,||}.}}}.,,)))},}},)),,.))}}},})}}})))))}|......,,,|{{{{{{,..,}))))}..,,))..))))))).)).))))))))))))..))))))))))))((((((...))))))..(((((((..,,.{{{,...,}))}...))))))).}.,,(({{{.{{{..,.,,,,...}))))))}...(((((..,,....,,..)))))........,{...,,,{.....(((.....((((((.((((.(...........).))))..)))))).....))),,,}...}..)))))))}.)))))))..,,,}}),}....{(((((..(((((((((((((({.,{(((.(((((..(((...(((((..((((......(((((.....)))))...))))))))).)).)..)))))..)))).}))))))))..)))))).)))))})))).))))))))))))..)))))))))))((((((((,((..(((((((((.((((((....((((.....)))))))))).....)))))))))..}),,((((.((.,...,.))))))))))))))...))))).))).(((.((..((((..(((((((............))))))))))).)).)))(((((..{{.((((((({({{({,.,,,}|||||,|||.,..,,,..|||,,,.,.....,(((((.((......)).)))))|((..(((((((,.((((((((((({.{{({{{,((((((,.,(((({.{({{{|||,|||.}|||||{{{(,......|||||||}}|.,|||.,|}.,|||}}}}||||{{{{((|..,))})}.,,,}))}}},))))..,))))))))))))).}{((({{{.,,,(({(({{((..(({{{{,,,{{(((((.......((......)).....,.}}}||}}{,{{{{,,,......}}},}}})}|{({,...,.)).,...((((.(((((((.......(((((.((((((((..{{..(((((((((,(((((((((({((((((......(((....)))...,..))))))....(((((.........)))||(((((...((((,.{,(((((.(((...,.,.,{(((({....,...,,{.(((......)))..,,.((((((...)))))).(((((.(((((((((((((........,))))))).{(((.,((({(,,{...,,,})).,)))).((.,....}},))}..)))))),)))))......,((((.(((.(((((.((((((....((((....((.......)}))))..))))))...))).)).))))))),.(((((((.(((...))))))))))(((,(((((,(((..,{(((.{.(((((.....((((.....))))...,((,,{{{(((.(((..{{,((((,.....{{{{{.,||}|,{{,......),,,,.,}...||.|{{{{{,..})}}}}}}..,,,||||.........,,,))))...,.......))))).,....,..}}}}),}}....,),..}})))),,}}))))).}.))))})))))))).))),...))}}}|((((........)))),}))...),)))}),})))).})))),.,)))))))))),.).)))))..........))))..}})))))))))))))))))))).))))...))}))..)})))))}.).})})))))))))}}}.,))..||{|||,.,))))))||....,.},,}}}...)),,)))))(({{({,(((,..,}))))))..,.......,,.,|,...,}))}))..,||}},,}))}.,,.))),.)))}...)))))),)))........,|||{,{,|||||.,|||||{{{{|....,},))))))).)))),,|(((.((((((.,((((....,{{{.,{{({((((.,.{{{|||{({....,,.....,,|,...,})}}..,.,.|{||.||...,)),))))|}|}.}}}|}}||..}}}}....,|||,,..}))|,{((((((....)))))))}}.}}}..)))))).))))).}}})))))))).))))}}}....|||||{,{||,....,,|,|...((((((.((.{{,...((((.....((((,...,))))}))).}}}..}}.)))))).{(((.,({....},})))}.,.{((((((.......)))))}}||,{(((((({....)))))))}.}}|,,.....,..{|||{,,||,,....,..}}}}}....}))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GCUUUCUGCACGUCCUCGCCGCCGCGCCGCCAGUCCGUUUGUGCUAGCU… 7250 nt 0.4434
Summary

The protein encoded by this gene is a cytosolic prolyl endopeptidase that cleaves peptide bonds on the C-terminal side of prolyl residues within peptides that are up to approximately 30 amino acids long. Prolyl endopeptidases have been reported to be involved in the maturation and degradation of peptide hormones and neuropeptides. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.