Basic Information

Symbol
PREX2
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylinositol-3,4,5-Trisphosphate Dependent Rac Exchange Factor 2 PPP1R129 P-REX2 DEPDC2 DEP.2 Phosphatidylinositol 3,4,5-Trisphosphate-Dependent Rac Exchanger 2 Protein Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 129 PtdIns(3,4,5)-Dependent Rac Exchanger 2 DEP Domain-Containing Protein 2 FLJ12987 Phosphatidylinositol-3,4,5-Trisphosphate-Dependent Rac Exchange Factor 2 DEP Domain Containing 2 P-Rex2
Location (GRCh38)
8:67951955-68237032
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_024870.4
Sequence length
10824.0 nt
GC content
0.3916

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2932.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3138.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2813.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_024870.4 NCBI
AGCUUUUGAUUAAUGUCCAAGUCACUGCUGUGGCUGCCGAAGCCGCUUC… 10824 nt 0.3916
NM_025170.6 NCBI
AGCUUUUGAUUAAUGUCCAAGUCACUGCUGUGGCUGCCGAAGCCGCUUC… 3936 nt 0.4393
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate (PIP3)-dependent Rac exchanger (PREX) family, which are Dbl-type guanine-nucleotide exchange factors for Rac family small G proteins. Structural domains of this protein include the catalytic diffuse B-cell lymphoma homology and pleckstrin homology (DHPH) domain, two disheveled, EGL-10, and pleckstrin homology (DEP) domains, two PDZ domains, and a C-terminal inositol polyphosphate-4 phosphatase (IP4P) domain that is found in one of the isoforms. This protein facilitates the exchange of GDP for GTP on Rac1, allowing the GTP-bound Rac1 to activate downstream effectors. Studies also show that the pleckstrin homology domain of this protein interacts with the phosphatase and tensin homolog (PTEN) gene product to inhibit PTEN phosphatase activity, thus activating the phosphoinositide-3 kinase (PI3K) signaling pathway. Conversely, the PTEN gene product has also been shown to inhibit the GEF activity of this protein. This gene plays a role in insulin-signaling pathways, and either mutations or overexpression of this gene have been observed in some cancers. [provided by RefSeq, Apr 2016] CIViC Summary for PREX2 Gene

Forensic Context

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