Basic Information

Symbol
PRKACB
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase CAMP-Activated Catalytic Subunit Beta CAMP-Dependent Protein Kinase Catalytic Subunit Beta PKA C-Beta PKACb Protein Kinase, CAMP-Dependent, Beta Catalytic Subunit Protein Kinase, CAMP-Dependent, Catalytic, Beta EC 2.7.11.11 Protein Kinase A Catalytic Subunit Beta EC 2.7.11 CAFD2
Location (GRCh38)
1:84078062-84238498
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Forensic psychiatry evaluation Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182948.4
Sequence length
4481.0 nt
GC content
0.3559

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1074.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1166.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1037.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001242857.3 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 4378 nt 0.3561
NM_001242858.3 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 4321 nt 0.3552
NM_001242859.3 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 4369 nt 0.3561
NM_001242860.3 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 4580 nt 0.3563
NM_001242861.3 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 4472 nt 0.3567
NM_001242862.3 NCBI
AGAGAAAGCCACUAGGCUCUCUCAUGCUGCUACUAUCUAGUUCUAUAAG… 4233 nt 0.3534
NM_001300915.2 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 2055 nt 0.3343
NM_001300916.2 NCBI
ACAUGCAUAGCUCUUAGCUUCUGUGUAAGAAGUUGUGAGCUCCUUCUGG… 1953 nt 0.3318
NM_001300917.2 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 1793 nt 0.3279
NM_001375560.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 4571 nt 0.3564
Showing 1 to 10 of 30 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the serine/threonine protein kinase family. The encoded protein is a catalytic subunit of cAMP (cyclic AMP)-dependent protein kinase, which mediates signalling though cAMP. cAMP signaling is important to a number of processes, including cell proliferaton and differentiation. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PRKACB is down-regulated in the post-mortem anterior temporal lobe of individuals with chronic traumatic encephalopathy (CTE), CTE with Alzheimer's disease (CTE/AD), and Alzheimer's disease (AD) compared to normal subjects, as part of a broader down-regulation of memory function and long-term potentiation-related genes [Cho et al. DOI:10.1038/s41598-020-65916-y]. In rats, transcriptome profiling of whisker follicles from a methamphetamine self-administration model identified the PRKACB as a potential regulator of drug reward and addiction, showing an up-down expression pattern after administration and withdrawal and ranking with a betweenness centrality score of 0.0447 [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1].