Basic Information

Symbol
PRKACB
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase CAMP-Activated Catalytic Subunit Beta CAMP-Dependent Protein Kinase Catalytic Subunit Beta PKA C-Beta PKACb Protein Kinase, CAMP-Dependent, Beta Catalytic Subunit Protein Kinase, CAMP-Dependent, Catalytic, Beta EC 2.7.11.11 Protein Kinase A Catalytic Subunit Beta EC 2.7.11 CAFD2
Location (GRCh38)
1:84078062-84238498
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Forensic psychiatry evaluation Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182948.4
Sequence length
4481.0 nt
GC content
0.3559

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1074.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1166.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1037.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001375561.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 4556 nt 0.3558
NM_001375562.1 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 4354 nt 0.3555
NM_001375563.1 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 4345 nt 0.3556
NM_001375564.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 4547 nt 0.3558
NM_001375565.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 4523 nt 0.3555
NM_001375569.1 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 1850 nt 0.3308
NM_001375571.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 2052 nt 0.3338
NM_001375572.1 NCBI
ACACAGCAUUUUAAUAUCAGUGAGGUCCACAGCUAGCAGUAAGAGCUGG… 1844 nt 0.3313
NM_001375573.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 2046 nt 0.3343
NM_001375574.1 NCBI
GCCAUUUUGAGUUGUUCUAGUGGUAUAUGAAGGAGGCUGGGAUAACUAG… 2031 nt 0.3328
Showing 11 to 20 of 30 entries
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the serine/threonine protein kinase family. The encoded protein is a catalytic subunit of cAMP (cyclic AMP)-dependent protein kinase, which mediates signalling though cAMP. cAMP signaling is important to a number of processes, including cell proliferaton and differentiation. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Jul 2014]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PRKACB is down-regulated in the post-mortem anterior temporal lobe of individuals with chronic traumatic encephalopathy (CTE), CTE with Alzheimer's disease (CTE/AD), and Alzheimer's disease (AD) compared to normal subjects, as part of a broader down-regulation of memory function and long-term potentiation-related genes [Cho et al. DOI:10.1038/s41598-020-65916-y]. In rats, transcriptome profiling of whisker follicles from a methamphetamine self-administration model identified the PRKACB as a potential regulator of drug reward and addiction, showing an up-down expression pattern after administration and withdrawal and ranking with a betweenness centrality score of 0.0447 [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1].