Basic Information

Symbol
PRKAR1B
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase CAMP-Dependent Type I Regulatory Subunit Beta Protein Kinase, CAMP-Dependent, Regulatory Subunit Type I Beta CAMP-Dependent Protein Kinase Type I-Beta Regulatory Subunit Protein Kinase, CAMP-Dependent, Regulatory, Type I, Beta PRKAR1 MASNS
Location (GRCh38)
7:549196-728268
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001164760.2
Sequence length
2472.0 nt
GC content
0.6290

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1058.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1099.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 736.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164758.2 NCBI
GGAGUGAGGUGAGUGAGGGCCAAGCAGGAACAGGGGUCACGGGGCAAGG… 2473 nt 0.6256
NM_001164759.1 NCBI
AGCAAGGGGACAGGGGAGUGAGGAAGGAAGCAGCCACCCUCGCCAUGGC… 2423 nt 0.6253
NM_001164760.2 NCBI
GCAGCUCUCGCGGCGCACGGCGGCGAAGGGGUCGAGCAGGGAGCAGCGC… 2472 nt 0.6290
NM_001164761.2 NCBI
CCUUUCCUGCAGGGCUGGGCUUGUGGGUUAGGACCGUCACCAAGAGGCU… 2487 nt 0.6244
NM_001164762.2 NCBI
CUCUGGCCGCUAAGGCAGAGUGAGACCCCAGGGAACGGGCGUGCUUGCU… 2493 nt 0.6258
NM_002735.3 NCBI
AGUGCGGGGACCCGCUCGCUCGCUCGCCAGCCGUCCCCGCGCCCCGCGU… 2491 nt 0.6323
Summary

The protein encoded by this gene is a regulatory subunit of cyclic AMP-dependent protein kinase A (PKA), which is involved in the signaling pathway of the second messenger cAMP. Two regulatory and two catalytic subunits form the PKA holoenzyme, disbands after cAMP binding. The holoenzyme is involved in many cellular events, including ion transport, metabolism, and transcription. Several transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the protein-coding gene transcript Prkar1b is a member of a brain co-expression module associated with voluntary alcohol consumption [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698].