Basic Information

Symbol
PRKCD
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase C Delta Tyrosine-Protein Kinase PRKCD Protein Kinase C Delta Type EC 2.7.11.13 NPKC-Delta PKCD Protein Kinase C Delta VIII Protein Kinase C, Delta EC 2.7.10.2 EC 2.7.11 ALPS3 CVID9 MAY1
Location (GRCh38)
3:53156009-53192717
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006254.4
Sequence length
2833.0 nt
GC content
0.5549

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1036.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1084.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 668.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001316327.2 NCBI
AGUUCCCGUUUCCGAAACUGAGAAACUGAGCCGCGGUCAGCGAAAGUCC… 2682 nt 0.5362
NM_001354676.2 NCBI
AGCAAGCCCAGAGGCUCCUAAGCGGGAAGGAACUGGCUGCUUCGGGAAC… 2619 nt 0.5330
NM_001354678.2 NCBI
AGCAAGCCCAGAGGCUCCUAAGCGGGAAGGAACUGGCUGCUUCGGGAAC… 2610 nt 0.5326
NM_001354679.2 NCBI
GCACUUCCGUGUGCCGCGGCGCCGGAGCCCGAGGCGGCUGUAGCCCACA… 2837 nt 0.5495
NM_001354680.2 NCBI
GCACUUCCGUGUGCCGCGGCGCCGGAGCCCGAGGCGGCUGUAGCCCACA… 2949 nt 0.5534
NM_006254.4 NCBI
GCACUUCCGUGUGCCGCGGCGCCGGAGCCCGAGGCGGCUGUAGCCCACA… 2833 nt 0.5549
NM_212539.2 NCBI
GCACUUCCGUGUGCCGCGGCGCCGGAGCCCGAGGCGGCUGUAGCCCACA… 2721 nt 0.5509
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the protein kinase C family of serine- and threonine-specific protein kinases. The encoded protein is activated by diacylglycerol and is both a tumor suppressor and a positive regulator of cell cycle progression. Also, this protein can positively or negatively regulate apoptosis. Defects in this gene are a cause of autoimmune lymphoproliferative syndrome. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PRKCD is a direct target of microRNA-26a, where miR-26a overexpression in human umbilical vein endothelial cells significantly inhibited PRKCD protein expression [Li et al. DOI:10.3892/etm.2017.5183].