Basic Information

Symbol
PRKD1
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase D1 PKD PKC-Mu PRKCM PKCM Serine/Threonine-Protein Kinase D1 Protein Kinase C Mu Type Protein Kinase C, Mu Protein Kinase D EC 2.7.11.13 NPKC-D1 NPKC-Mu EC 2.7.11 CHDED PKD1
Location (GRCh38)
14:29576479-30191898
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002742.3
Sequence length
3833.0 nt
GC content
0.4806

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1188.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1257.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1192.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330069.2 NCBI
GUCGCCCCGUCCUUCCGAGCGCGCCAGGCGGCAGAUUCUUGGCGGCGGC… 3857 nt 0.4809
NM_001348390.1 NCBI
GGACGCCUGCAACCCGAGGCGCUGCGCUCGCUGUUGCUCAUCCUCCUCU… 3389 nt 0.4435
NM_002742.3 NCBI
GUCGCCCCGUCCUUCCGAGCGCGCCAGGCGGCAGAUUCUUGGCGGCGGC… 3833 nt 0.4806
Summary

The protein encoded by this gene is a serine/threonine protein kinase involved in many cellular processes, including Golgi body membrane integrity and transport, cell migration and differentiation, MAPK8/JNK1 and Ras pathway signaling, MAPK1/3 (ERK1/2) pathway signaling, cell survival, and regulation of cell shape and adhesion. [provided by RefSeq, Jan 2017]

Forensic Context

A study in human patients with heat stroke demonstrated that exosomes derived from their plasma exhibited significant changes in molecular cargo, with qPCR verification confirming the significant upregulation of multiple targeted mRNAs, including the PRKD1 (PRKD1), which is associated with inflammatory response [Li et al. DOI:10.3389/fimmu.2021.624753].