Basic Information

Symbol
PRKG2
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase CGMP-Dependent 2 PRKGR2 CGKII PKG2 Protein Kinase, CGMP-Dependent, Type II CGMP-Dependent Protein Kinase II CGMP-Dependent Protein Kinase 2 EC 2.7.11.12 CGK2 Testicular Tissue Protein Li 99 EC 2.7.11 CGK 2 AMD4 SMDP
Location (GRCh38)
4:81086874-81217970
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006259.3
Sequence length
4922.0 nt
GC content
0.4149

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1392.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1488.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1112.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282480.1 NCBI
AGACUGCUGUGCUAGCAAUCAGCAAGACUCCGUGGGCGUAGGACCCUCC… 3897 nt 0.3777
NM_001282481.1 NCBI
AGACUGCUGUGCUAGCAAUCAGCAAGACUCCGUGGGCGUAGGACCCUCC… 3771 nt 0.3755
NM_001282482.1 NCBI
AGACUGCUGUGCUAGCAAUCAGCAAGACUCCGUGGGCGUAGGACCCUCC… 3684 nt 0.3727
NM_001282483.1 NCBI
AGACUGCUGUGCUAGCAAUCAGCAAGACUCCGUGGGCGUAGGACCCUCC… 3748 nt 0.3746
NM_001282485.2 NCBI
GCACCGGCCCCCGCCGCGGAGCCAGGCGGCAGCACCGACGCCGCCGCAG… 4835 nt 0.4134
NM_001363401.2 NCBI
GCACCGGCCCCCGCCGCGGAGCCAGGCGGCAGCACCGACGCCGCCGCAG… 4927 nt 0.4151
NM_006259.3 NCBI
GCACCGGCCCCCGCCGCGGAGCCAGGCGGCAGCACCGACGCCGCCGCAG… 4922 nt 0.4149
Summary

This gene encodes a protein that belongs to the serine/threonine protein kinase family of proteins. The encoded protein binds to and inhibits the activation of several receptor tyrosine kinases. The membrane-bound protein is a regulator of intestinal secretion, bone growth and renin secretion. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms whose regulatory N-termini differ in length but whose C-terminal catalytic domains are identical. [provided by RefSeq, May 2018]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PRKG2 (Prkg2) was identified as a potential regulator of methamphetamine reward and addiction through transcriptome profiling of whisker follicles, where its expression was down-down regulated (0.51 at MASA, 0.09 at WD) and it was topologically prioritized with a betweenness centrality score of 0.0158 [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1].