Basic Information

Symbol
ACADS
RNA class
mRNA
Alias
Acyl-CoA Dehydrogenase Short Chain SCAD ACAD3 Short-Chain Specific Acyl-CoA Dehydrogenase, Mitochondrial Acyl-Coenzyme A Dehydrogenase, C-2 To C-3 Short Chain Butyryl-CoA Dehydrogenase Mitochondrial Short-Chain Specific Acyl-CoA Dehydrogenase Acyl-CoA Dehydrogenase, C-2 To C-3 Short Chain Epididymis Secretory Sperm Binding Protein Unsaturated Acyl-CoA Reductase EC 1.3.99.2 EC 1.3.8.1 EC 1.3.99
Location (GRCh38)
12:120725774-120740009
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000017.4
Sequence length
1859.0 nt
GC content
0.6374

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-862.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -890.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 493.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((....(((..(((.(...).)))..)))....)).((((((((((.(((.((((..((((...(((.....)))...)))).(((((((((...(((((....)))))..)))))))))((((((((((((((.(((.((((.((((..((.....))..)))).......(((((......)))))(((((.(((..((((((.(((((.(((((((((((........)))))....)))))).))))).((((.(((((((((...(........)..))))))))).))))((.(((......))).))..))))))))).)))))(((.((((((((.((.(((((...(((((((..(....)..))))))).((((((.(.(((.((((.....((((.......)))).......(((((((..........((((.((((....))))..))))(((((((...))))))).(((((...)))))........((((((...((((.........))))...))))))(((((((...))))))).....((((((((((((((((((.......((((((....))))))......(((....)))..(((((((((((....((((..(((((((.((((((...(.((.(((((((........))))).)).)).)((((....((((((.(((........)))......)))))).....))))....((..((((((.(((((((((((..(((...(((((....))))).........(((((.((((.....)))).))))))))..)))))))))))..))).)))..)).....)))).)).)))))))..))))...))))))))))).((((((...))))))..))))))))...(((((((.((((..((((.((......((((((..(((((............)))))))))))))))))...)))).)))).)))((((((((((((((..((((((((((.(((((..((((((((.(((.((.((((((............)))))).))..(((((.((((.(......))))).)))))...))).)))..))))))))))..(((.(((.(((((...))))).))).))).((.((((((((.(((((.(((...((((.....))))...))).))))).)))...)).)))))(((((((((...........))))))).)))))))))).))..))))).))))..)).)))..))))).)))))...))))))))))).)))).))))))((((.((..(((((((((.((..((((((((((...(((((((.(((..((((.((((((.(((((...)))))..))))))..))))))).))))).))..........(((..(((((((...((.....(((......))))).))))))))))((.((((.(((.(((.((((((((..............(((((((.(((....))).)))))))((((((((((........(((.(((....))).))).))))))))))(((((.(.((((....)))).).))))).....((((((((((....)))))))))).....))))))))))).))).)))))).))))))))))..)).))..))))))).)).))))))))).)).)))))))).)))((((((((......))))))))..((((((..(((.(((((........))))))))))))))))))....))).)))))))))).)))))))).))).)))))...)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,((.,{,{{{({({...,)))(((((.(((..{(((..((.(((.((((.({..(((((((.((((.(((.((((((((((((.,(((((({(,,,((({(..,.|}|}},.|}|||||||||((((((,.((((..........}..))))..)))))).{{{.,{{,....,|||{,}}}..,,,,,|}}}}}.|||,{{{{,,..(({({((({{{{,,,{,}},|,,.}}))}....)}}}||{|||||{|{..,,,}...)),}})),,}}}|{|||}||{.}||||}..))))..)).,.,}}})))).))).))))((((..((((..........))))..))))...))))))).}|)))})))))..)))))))))))).|||,||{{{{{{{((((,......}}}}{{{{{.{((((((((.,.{{...}).,.)))))),.)))).))},{,(((((((...))))))}.{{{{{.,.))))),.....,,|}||},{(((((((.((...((.(((..(((..(((((((((...))))))}}))..)))))))))).)))))))),.,,.,((((((....))))))..(((.((((((((({..(((((((((((....((((..(((((((.((((((...{,({.(((((((........))))).)).)),)((((.,..((((((.(((........)))....,.)))))).....))))....((..((((((.(((((((((((..(((...(((((....)))))...},.,,.(((((.((((.....)))).))))}))}..)))))))))))..))).)))..)).....)))).)).)))))))..))))...))))))))))).((((((...))))))...((((.(((..((..(((((.{{......})..)))))..))..)))))))((((..(((((.((((((((((,{((,,.....,||},{,,,|.(((((((((((((({(((({(((((((.(((((..((((((((.(((.{,,((((((..........,|}||}}}.,,.,|||||.{{{,.(((,...})))),))))),,.))).)))..))))))))))..(((.(((.(((((...))))).))).))).((.((((((((.(((((.(((...((((.....))))...))).))))).)))...)).))),}||(((((((...........))))))).,})))))))}||,((((.((.....)).)))).|||||||,({((({(((((,,,({.{{(((,...,,)))}},,|||.((((((((...({{{.,,,,||,{|.{{..(((((.(({..|(({.(((({(.(((((...)))))..))))))..)))}))).))))).}).}},}...))))...}}|}}})},,,.}}...))))).})}))).})))))))))))|.(((((.(((.(((.((((((((..,,,{{{....,.|((((((.(((,...))),))))))}((((((((((,(((.,,,,{|.{((....))).})}.))))))))))(((((.(.((((....)))).).))))).,.,.((((((((((....)))))))))).....))))))))))).))).))))))))))))))))))))},))....)))))))))),.)))))..)))).{,({{.((((((((((((......))))))}..,)))))})},}(((((((....((....))..))))))))))))))))).))),,)))},)}}))|}|}|,.,,..,},},.,}))}}}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000017.4 NCBI
ACUCCGGAACAGCGCGCUCGCAGCGGGAGGUCGCGAAGCCUGGGACUGU… 1859 nt 0.6374
NM_001302554.2 NCBI
ACUCCGGAACAGCGCGCUCGCAGCGGGAGGUCGCGAAGCCUGGGACUGU… 1847 nt 0.6372
Summary

This gene encodes a tetrameric mitochondrial flavoprotein, which is a member of the acyl-CoA dehydrogenase family. This enzyme catalyzes the initial step of the mitochondrial fatty acid beta-oxidation pathway. Mutations in this gene have been associated with short-chain acyl-CoA dehydrogenase (SCAD) deficiency. Alternative splicing results in two variants which encode different isoforms. [provided by RefSeq, Oct 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.