Basic Information

Symbol
ATG2B
RNA class
mRNA
Alias
Autophagy Related 2B C14orf103 BLTP4B Bridge-Like Lipid Transfer Protein Family Member 4B Autophagy-Related Protein 2 Homolog B FLJ10242 ATG2 Autophagy Related 2 Homolog B (S. Cerevisiae) Chromosome 14 Open Reading Frame 103 ATG2 Autophagy Related 2 Homolog B
Location (GRCh38)
14:96279195-96363341
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018036.7
Sequence length
13162.0 nt
GC content
0.4291

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3866.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4115.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3169.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018036.7 NCBI
ACAGCCGGGAACGCGCCUCGCGGAUGACAACAAAUUCGUCGCGCGGCGG… 13162 nt 0.4291
Summary

This gene encodes a protein required for autophagy. The encoded protein is involved in autophagosome formation. A germline duplication of a region that includes this gene is associated with predisposition to myeloid malignancies. [provided by RefSeq, Jul 2016]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the ATG2B in microglia, where it is involved in the autophagy pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].