Basic Information

Symbol
PRMT1
RNA class
mRNA
Alias
Protein Arginine Methyltransferase 1 HRMT1L2 HCP1 ANM1 HMT1 (HnRNP Methyltransferase, S. Cerevisiae)-Like 2 Histone-Arginine N-Methyltransferase PRMT1 Protein Arginine N-Methyltransferase 1 Interferon Receptor 1-Bound Protein 4 Highly Conserved Protein 1 IR1B4 Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein Methyltransferase 1-Like 2 HMT1 HnRNP Methyltransferase-Like 2 (S. Cerevisiae) EC 2.1.1.319 EC 2.1.1.77 EC 2.1.1 HMT2
Location (GRCh38)
19:49675786-49689029
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001536.6
Sequence length
1328.0 nt
GC content
0.5791

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-511.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -532.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 215.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001207042.3 NCBI
GCGGGUGAAGAUGGCGGCAGCCGAGGCCGCGAACUGCAUCAUGGAGGUG… 1070 nt 0.5860
NM_001536.6 NCBI
GCGGGUGAAGAUGGCGGCAGCCGAGGCCGCGAACUGCAUCAUGGAGAAU… 1328 nt 0.5791
NM_198318.5 NCBI
GCGGGUGAAGAUGGCGGCAGCCGAGGCCGCGAACUGCAUCAUGGAGGUG… 1274 nt 0.5824
Summary

This gene encodes a member of the protein arginine N-methyltransferase (PRMT) family. Post-translational modification of target proteins by PRMTs plays an important regulatory role in many biological processes, whereby PRMTs methylate arginine residues by transferring methyl groups from S-adenosyl-L-methionine to terminal guanidino nitrogen atoms. The encoded protein is a type I PRMT and is responsible for the majority of cellular arginine methylation activity. Increased expression of this gene may play a role in many types of cancer. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 5. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.