Basic Information

Symbol
PRMT3
RNA class
mRNA
Alias
Protein Arginine Methyltransferase 3 HRMT1L3 Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein Methyltransferase-Like Protein 3 Protein Arginine N-Methyltransferase 3 HMT1 HnRNP Methyltransferase-Like 3 (S. Cerevisiae) HMT1 HnRNP Methyltransferase-Like 3 EC 2.1.1.319 EC 2.1.1
Location (GRCh38)
11:20387549-20509350
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005788.4
Sequence length
2552.0 nt
GC content
0.3821

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-668.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -725.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 539.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145166.2 NCBI
AGACACGCCGGGCUCUCGGGGCACCACAGCCAUGUGCUCGUUAGCGUCA… 2366 nt 0.3694
NM_001145167.2 NCBI
AGACACGCCGGGCUCUCGGGGCACCACAGCCAUGUGCUCGUUAGCGUCA… 2416 nt 0.3663
NM_005788.4 NCBI
AGACACGCCGGGCUCUCGGGGCACCACAGCCAUGUGCUCGUUAGCGUCA… 2552 nt 0.3821
Summary

This gene belongs to the protein arginine methyltransferase (PRMT) family. The encoded enzyme catalyzes the methylation of guanidino nitrogens of arginyl residues of proteins. The enzyme acts on 40S ribosomal protein S2 (rpS2), which is its major in-vivo substrate, and is involved in the proper maturation of the 80S ribosome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.