Basic Information

Symbol
PROC
RNA class
mRNA
Alias
Protein C, Inactivator Of Coagulation Factors Va And VIIIa Vitamin K-Dependent Protein C Blood Coagulation Factor XIV Anticoagulant Protein C Coagulation Factor XIV Autoprothrombin IIA Prepro-Protein C EC 3.4.21.69 Protein C (Inactivator Of Coagulation Factors Va And VIIIa) Activated Protein C Protein C-Nagoya Type I Protein C EC 3.4.21 PROC1 THPH3 THPH4 APC PC
Location (GRCh38)
2:127415933-127429762
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000312.4
Sequence length
1769.0 nt
GC content
0.5964

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-735.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -766.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 573.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000312.4 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1769 nt 0.5964
NM_001375602.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1885 nt 0.6005
NM_001375603.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1867 nt 0.6085
NM_001375604.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1765 nt 0.5966
NM_001375605.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1871 nt 0.6082
NM_001375606.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1870 nt 0.6027
NM_001375607.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1888 nt 0.6096
NM_001375608.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1712 nt 0.5970
NM_001375609.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1678 nt 0.5959
NM_001375610.1 NCBI
AACUCGAACUCCAGGCUGUCAUGGCGGCAGGACGGCGAACUUGCAGUAU… 1763 nt 0.5967
Showing 1 to 10 of 12 entries
Summary

This gene encodes a vitamin K-dependent plasma glycoprotein. The encoded protein is cleaved to its activated form by the thrombin-thrombomodulin complex. This activated form contains a serine protease domain and functions in degradation of the activated forms of coagulation factors V and VIII. Mutations in this gene have been associated with thrombophilia due to protein C deficiency, neonatal purpura fulminans, and recurrent venous thrombosis.[provided by RefSeq, Dec 2009]

Forensic Context

A systematic review of postmortem human brain studies found that the PROC, a mature oligodendrocyte marker, was used in maturational staging analyses within the ventromedial prefrontal cortex of individuals who died by suicide [Yamamoto et al. DOI:10.3390/Ijms25115750].