Basic Information

Symbol
PRODH
RNA class
mRNA
Alias
Proline Dehydrogenase 1 PIG6 HSPOX2 PRODH1 PRODH2 TP53I6 POX Proline Dehydrogenase 1, Mitochondrial P53-Induced Gene 6 Protein P53 Inducible Gene 6 Proline Oxidase 2 Proline Oxidase Proline Dehydrogenase (Proline Oxidase ) Tumor Protein P53 Inducible Protein 6 Proline Dehydrogenase (Oxidase) 1 Proline Oxidase, Mitochondrial EC 1.5.99.8 EC 1.5.5.2 POX2
Location (GRCh38)
22:18912774-18936553
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016335.6
Sequence length
2203.0 nt
GC content
0.6296

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-981.52 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1018.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 521.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001195226.2 NCBI
GGUCUCACUCUGUUGCUGUCUUCACGGAGAGCAGGAGCAGAGGCUUUGA… 2088 nt 0.6054
NM_001368250.2 NCBI
CCCGCCAUGGCUCUGAGGCGCGCCCUGCCCGCGCUGCGCCCCUGCAUUC… 2048 nt 0.6191
NM_016335.6 NCBI
CCCGCCAUGGCUCUGAGGCGCGCCCUGCCCGCGCUGCGCCCCUGCAUUC… 2203 nt 0.6296
Summary

This gene encodes a mitochondrial protein that catalyzes the first step in proline degradation. Mutations in this gene are associated with hyperprolinemia type 1 and susceptibility to schizophrenia 4 (SCZD4). This gene is located on chromosome 22q11.21, a region which has also been associated with the contiguous gene deletion syndromes, DiGeorge and CATCH22. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2010]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that non-targeted metabolomic profiling of iliopsoas muscle identified numerous differential metabolites for discriminating fatal hypothermia from hypoxia and control deaths, with machine learning models achieving high predictive accuracy [Li et al. DOI:10.1016/J.Jflm.2026.103089].