Basic Information

Symbol
PROK2
RNA class
mRNA
Alias
Prokineticin 2 PK2 BV8 Protein Bv8 Homolog MIT1 KAL4 Prokineticin-2 HH4
Location (GRCh38)
3:71771655-71785206
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001126128.2
Sequence length
1555.0 nt
GC content
0.4212

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-426.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -455.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 425.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001126128.2 NCBI
GCCGCGCCCGUCCGCCCGCCGCUCCGCGCUCCACCCAGCGCACCCGGGC… 1555 nt 0.4212
NM_021935.4 NCBI
GCCGCGCCCGUCCGCCCGCCGCUCCGCGCUCCACCCAGCGCACCCGGGC… 1492 nt 0.4229
Summary

This gene encodes a protein expressed in the suprachiasmatic nucleus (SCN) circadian clock that may function as the output component of the circadian clock. The secreted form of the encoded protein may also serve as a chemoattractant for neuronal precursor cells in the olfactory bulb. Proteins from other vertebrates which are similar to this gene product were isolated based on homology to snake venom and secretions from frog skin, and have been shown to have diverse functions. Mutations in this gene are associated with Kallmann syndrome 4. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the PROK2 as a core ferroptosis-related diagnostic biomarker for heat stroke, with its altered expression potentially representing an endogenous protective mechanism that limits ferroptosis by inducing Fbxo10-mediated degradation of ACSL4, and validation via ROC analysis on a patient cohort showed an AUC of 0.976 [Yin et al. DOI:10.1186/s12920-025-02188-3]. A separate study in mice demonstrated that the PROK2 transcript, categorized as a pro-inflammatory cytokine, increased in relative abundance within 1 hour postmortem [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].