Basic Information
Symbol
PROS1
RNA class
mRNA
Alias
Protein S
PROS
Vitamin K-Dependent Protein S
Protein S (Alpha)
Vitamin K-Dependent Plasma Protein S
Protein Sa
EC 3.4.21
THPH5
THPH6
PS21
PS22
PS23
PS24
PS25
PSA
Location (GRCh38)
3:93873046-93980003
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
Mixture deconvolution
Individual identification
MANE select
Transcript ID
NM_000313.4
Sequence length
3372.0 nt
GC content
0.3953
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-914.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-981.03 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1059.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUUCCGCCGAGGCUCGCUGGGUCGCUGGCGCCGCCGCGCAGCACGGCUC… | 3372 nt | 0.3953 | |
| GUUCCGCCGAGGCUCGCUGGGUCGCUGGCGCCGCCGCGCAGCACGGCUC… | 3468 nt | 0.3924 |
Summary
This gene encodes a vitamin K-dependent plasma protein that functions as a cofactor for the anticoagulant protease, activated protein C (APC) to inhibit blood coagulation. It is found in plasma in both a free, functionally active form and also in an inactive form complexed with C4b-binding protein. Mutations in this gene result in autosomal dominant hereditary thrombophilia. An inactive pseudogene of this locus is located at an adjacent region on chromosome 3. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms that may undergo similar processing to generate mature protein. [provided by RefSeq, Oct 2015]
Forensic Context
A study in humans demonstrated that the mRNA biomarker KLK3 is a highly effective and specific marker for semen identification, showing over 98% positive detection in both normal and infertile semen samples with minimal cross-reactivity in non-semen body fluids [Tian et al. DOI: 10.1002/elps.202000238]. Furthermore, KLK3 is highlighted in forensic science for its prowess in body fluid identification, and mRNA coding-region single-nucleotide polymorphisms (cSNPs) from such markers, including those within KLK3, present notable advantages for individual identification and deconvoluting mixture stains [Liu et al. DOI: 10.1002/elps.202400077]. A study in humans demonstrated that the PROS1 mRNA is a highly specific marker for semen identification using Real-Time PCR assays, showing no cross-reactivity from blood, vaginal secretion, saliva, or female urine [Nussbaumer et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2005.10.009]. The review further confirms the PROS1 as an established mRNA marker for semen identification via RT-PCR, highlighting its role within multiplex assays developed for forensic body fluid screening [Bauer, M. DOI:10.1016/j.fsigen.2006.11.002].