Basic Information

Symbol
PRPS2
RNA class
mRNA
Alias
Phosphoribosyl Pyrophosphate Synthetase 2 Phosphoribosyl Pyrophosphate Synthase II Ribose-Phosphate Pyrophosphokinase 2 Ribose-Phosphate Diphosphokinase 2 EC 2.7.6.1 PRS-II Testicular Secretory Protein Li 41 PPRibP Synthetase PRS II PPRibP PRSII
Location (GRCh38)
X:12791355-12824223
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002765.5
Sequence length
2469.0 nt
GC content
0.4261

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-701.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -747.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 505.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039091.3 NCBI
GCAGCAGCAGCCUCCCGCGUCGCUGUCGCUGUUGCCUCCGCCACCUCCU… 2478 nt 0.4266
NM_002765.5 NCBI
GCAGCAGCAGCCUCCCGCGUCGCUGUCGCUGUUGCCUCCGCCACCUCCU… 2469 nt 0.4261
Summary

This gene encodes a phosphoribosyl pyrophosphate synthetase that plays a central role in the synthesis of purines and pyrimidines. The encoded protein catalyzes the synthesis of 5-phosphoribosyl 1-pyrophosphate from ATP and D-ribose 5-phosphate. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in multiple species including *Homo sapiens*, *Drosophila melanogaster*, *Caenorhabditis elegans*, *Saccharomyces cerevisiae*, *Bacillus subtilis*, and *Escherichia coli* demonstrated that mRNA secondary structure stability, measured by minimum and mean folding free energy (ΔGmin and ΔGmean), positively correlates with protein compactness, measured by solvent accessibility (ACC), with stronger correlations in prokaryotes and in predicted ordered protein regions [Guilhem Faure et al. DOI:10.1093/nar/gkw671].