Basic Information

Symbol
PRR3
RNA class
mRNA
Alias
Proline Rich 3 CAT56 MHC Class I Region Proline-Rich Protein CAT56 Proline-Rich Protein 3 Em:AB014077.1 Em:AB023052.2 Proline-Rich Polypeptide 3 Proline-Rich Polpeptide 3
Location (GRCh38)
6:30557274-30563723
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025263.4
Sequence length
1845.0 nt
GC content
0.5127

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-597.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -630.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 424.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001077497.3 NCBI
AAAGCCGAGACUGCGUCCAGGUUGCUGGACUACACCGGGGGCACGGUCA… 2368 nt 0.5253
NM_025263.4 NCBI
CCCUUCCUCACUACCCUCCAAAUCCCGCUGCAGCCAUUGCCGCAGACAC… 1845 nt 0.5127
Summary

Enables RNA binding activity. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PRR3 was one of 14 mRNA markers selected via stepwise Fisher Discriminant Analysis to construct a multivariate model for estimating wound age in skeletal muscle contusions, where a model using these markers correctly classified 94.9% of cross-validated grouped cases into time intervals (4–12, 16–24, and 28–48 hours post-injury) and showed internal predictive validity with a root mean squared error of approximately 8 hours [Du et al. DOI:10.1007/s00414-018-01990-2].