Basic Information

Symbol
PRR30
RNA class
mRNA
Alias
Proline Rich 30 C2orf53 Proline-Rich Protein 30 MGC44505 Chromosome 2 Open Reading Frame 53
Location (GRCh38)
2:27136848-27139410
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_178553.4
Sequence length
2008.0 nt
GC content
0.6036

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-695.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -729.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 564.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_178553.4 NCBI
AGCUCCCAUUGGGGUCGGCGAACCUGGUGCCACCCCUUAGACAAAGUCC… 2008 nt 0.6036
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A study in mice demonstrated that irradiation of gastric tissue with 6 or 12 Gy X-rays induced mucosal atrophy and altered cell morphology, which was accompanied by increased serum levels of pepsinogen A and pepsinogen C [Chen et al. DOI:10.1177/1559325819886766].