Basic Information

Symbol
PRR5L
RNA class
mRNA
Alias
Proline Rich 5 Like Protein Observed With Rictor-2 PROTOR-2 Proline-Rich Protein 5-Like FLJ14213 PROTOR2 Protor-2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Time since deposition estimation

MANE select

Transcript ID
NM_001160167.2
Sequence length
3851.0 nt
GC content
0.4884

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1351.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1417.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1037.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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GCUUGGCAGUUUCCCAUUGCGGGGCAGCUGGGCCGGGGGCGGGGGUCGG… 3363 nt 0.4710
GUGUUGGCUACGUUUGUGGUUUUAAGAAAGCCUGAGGGCCUGAAGGCAG… 3588 nt 0.4783
GCUUGGCAGUUUCCCAUUGCGGGGCAGCUGGGCCGGGGGCGGGGGUCGG… 3950 nt 0.4911
Summary

Enables ubiquitin protein ligase binding activity. Involved in several processes, including TORC2 signaling; regulation of fibroblast migration; and regulation of primary metabolic process. Part of TORC2 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human blood samples stored at 4°C identified the PRR5L as one of 13 downregulated transcripts that overlapped with important variables in a random forest model for predicting the time since deposition of bloodstains [Zhang et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2024.111930]. This model, based on transcriptomic changes, successfully predicted TSD with high accuracy (AUC=0.995, precision=1, recall=1), and the PRR5L was characterized as a potential time-marker transcript for forensic application.