Basic Information

Symbol
PRRC2B
RNA class
mRNA
Alias
Proline Rich Coiled-Coil 2B KIAA0515 LQFBS-1 BAT2L1 BAT2L HLA-B-Associated Transcript 2-Like 1 Proline-Rich Coiled-Coil Protein 2B HLA-B Associated Transcript 2-Like Protein PRRC2B MGC10526 HLA-B Associated Transcript 2-Like 1 Proline-Rich Coiled-Coil 2B Protein BAT2-Like 1
Location (GRCh38)
9:131373636-131500197
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Individual identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_013318.4
Sequence length
11238.0 nt
GC content
0.5691

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4351.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4538.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3157.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001384818.1 NCBI
GAGACAGGCGCCGAGGCUCCACCGCGCAGCGACGAGCGAGCCCGGGAGG… 11242 nt 0.5692
NM_001384821.1 NCBI
GAGACAGGCGCCGAGGCUCCACCGCGCAGCGACGAGCGAGCCCGGGAGG… 11235 nt 0.5691
NM_001384822.1 NCBI
GCCUUCCGCUCUGGGCCGCCGCGAUUCUGGGCGUGCGUGAGGGAGGGUG… 11056 nt 0.5664
NM_001384823.1 NCBI
GAGACAGGCGCCGAGGCUCCACCGCGCAGCGACGAGCGAGCCCGGGAGG… 9078 nt 0.5608
NM_013318.4 NCBI
GAGACAGGCGCCGAGGCUCCACCGCGCAGCGACGAGCGAGCCCGGGAGG… 11238 nt 0.5691
Summary

Enables RNA binding activity. Predicted to be involved in cell differentiation. Predicted to act upstream of or within in utero embryonic development. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PRRC2B was identified as a housekeeping gene of unknown function that exhibited differential expression between a male monozygotic twin pair, belonging to the least variable category of random expression variation [Sharma et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00228.2003].