Basic Information

Symbol
PRRG3
RNA class
mRNA
Alias
Proline Rich And Gla Domain 3 TMG3 Proline Rich Gla (G-Carboxyglutamic Acid) 3 (Transmembrane) Transmembrane Gamma-Carboxyglutamic Acid Protein 3 Proline-Rich Gamma-Carboxyglutamic Acid Protein 3 Proline-Rich Gla Protein 3 PRGP3
Location (GRCh38)
X:151694607-151705924
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Cause of death analysis Sudden unexpected death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001372163.1
Sequence length
5705.0 nt
GC content
0.4943

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1943.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2050.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1254.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((.........)))))).((((((((.(.((..((......)).)).).))))))))..))))))(((((..(((((((.(((....((((.((((((.((((((((((((((....(((((((((.(((.((.((((.(((......((((.....))))))))))).))))))))(((((((..(((((((((((((.(((((.(.((((((((.((((((((((((..((((((((((.((((.(((.((((((((.((((((((((....((((.(((((((((((..((((..(((......(((((..((((....))))))))).((((.(((((.(....(((((((((.((((((((((((((((((((((.((.((...........((((((((((.(((....(((((......((.((((......(((((.((((((.(((..(((((((...((((...((.(((((..........)))))))..)))))))))))....))).))))))...))))).......))))...))....))))).....))).)))))))))).((((((.(((((((((((((.((((...((((.((..((((((....(((.........)))..))))))..)).)))))))).)).)).)))).....((((((...)))))).))))).)))))).)).))))))))))((((.((....)).))))........)))))))))......)))).)...)).)))))))...))))))))))...))).)))).(((((((.((.......))))))))).)))))))).))).))))..))))))))))...)))))))).)))(((....))).......)))).))))))))))((.(((....((((..((((....))))...)))).....))).))(((..(((.(((((((((((((((((((((((.((.(((.(.((((((((((((..(((((..((((...((.((.........((((......))))((((((((((((((((((((((..((((((.((((((.(..(((.(((((.((.......)).))).)))))..).))))))...((((.(((((...))))).))))((((((((.((.((((((((((...(((.((((((....(((....((((((...((((((.......))))))...))))))..)))....(((((((.((.(((((((((((...........))))))))))))))))))))............((((.....))))................................))))))))).)))))).))))..((((((....(((....(((((((......)))))))))))))))).......)).)).)))))).))))))..)))))))))))))).....((.(((((..(((((((((((((((((((((((((((((...........)))))).......))))))))))))))))).....((.(((.(((((....))))).))).))((((((.((((((..((...((((.(.(((.(((....)))..))).).))).)...))...))))))..))).)))((((((((((((....((((.....))))..))))).))))))).((((((..........))))))....(((((((.....((((...((((....((((((....))).((((((((((((((((((((.(((...(((....)))...)))))))).))))))))))))))).(((....)))..((((((((((((......))).))))..))))).....))))))))))).....)))))))))).))).)))))...))..........((((((((((((((.(((...))).)))......(((((((((((....(((((.....)))))......)).)))))).))).............(((((....)))))...((((((...............))))))....((((......))))((((.(((....))).)))).)))))))))))....)))))))))).)).).)))..)).)))..))))))..).))))).).)))....)).)).)))))))))))...((((((.((((((((((....))))......)))))))))))).)))))))))))))..)))...(((((((((.((((((.((.(((.....(((((((.(.((.......)))((((((((((((...(((((.(((((..((((..(((.((((((.(.(((.....(((.(((.......)))(((((........))))).((.(((((.(((((....))))).))))).))..(((....))).........))).....)))))))))).)))))))))))).).))))..))))))).......(((((((((((.(.(((((...((.......(((((((...(((((((.((((..((.((((((.(((((.......((((((((((......))))))))))(((((((((.((((((((((((.(((..(((((........)))))..))).)).))))))....(((((((.....(.(.((((........)))).).)......)))))))(((.(((((...((.((((((((((.(((..((((((....)).))))......(((((((((((((.(((..((........))..))).)))))))).)))))..))))))))))))))).)))))))))))))))))))))(((.((((((((((.(((((((((.....))))))))).))))......)))))).))))))).)...)))))))))))).)))))))((((.((((......)).)).))))((((......((((((.((((((((..(((...(((.....(((((.(.((((...((.((((((..(((((((((((((((((((.(((.(((.....((.((((((((.((((.((((.((((((..((((((.((((.......(((((((....)))))))..)))).)).))))..))............(((.........))))))).))))..)))).)))))))))))))))).))).))))))).......)))))).)))...)))))))).))))...).)))))..))))))..)))))))).)))))))))).)))))))...))..))))).).)))))))))))))))))))))))))).))))))))..)))).)))))..((((.(((((((((((((.........((((....))))..........)))))).)))).))).(((....)))((((((........)))))).))))....))))))))))))...)))))).)).).)))))....(((.....))))))))).)))))))...)))))))((((((.......))).)))(((((((.....(((..((((((((................................................................((((((.(((.((((((((((((..(.((((.((((((.........(((..(((..........)))..)))(((((.((.............(((((((((((......(((((((((((((((((((.((((((.((((...))))....))))))...)))).)))))))))))))))....))))))).))))..)))))))..((((((((......((((...(((((((...)))))))...)).))..)))))))))))))).)))))..))))))))))))))).))))))((((((((...((((.....)))).))))))))(((((....)))))))))))))..)))))))))).))))))....)))))))))))...(((((((((((((((....((((((((((..(((((.(......).))))).)))..)))))))..)))).....)))))))))))(((((......)))))..((((..((((((((((....(((((((((((.((...)).))).))))))))(((......(((.((((.((((((((((((((...(((((((......(((.((...(((......)))....))..))).....)))))))))))).....)))))))))(((((((((.(((.((.((((((((((((((((.((((...(((((((((((((((.....((((..(((((....)))))..))))((((((((....)))))))).(((((((((..(((...((((((((.(((...))).)))).((((((.(((......))))))))).(((((((.............................))))).))..................((((..(((..(((((((.....((((.((...)).)))).....))))))))))..)))).(((((((.......)))))))....(.(((..((((((.((................)).))))))))).).(((((((((...((((((.....((.......))......))))))...))))))))).(((..((((.........((((...(((((((...))))))))))).........))))..)))))))..)))..))))))))).((((((((.((((.(((((...((((.((........)).)))).))).)).))))))))))))(((((((.(((((((...(((..(((((((((...)))))))))..)))..)))))..)).)))))))........))))))))...............)))))))..)))))))).)))))...(((.((..((..(((((............................)))))....))..)).)))))))))))).))).)))))))))(..(((.....)))..)......................))))...)))...))).((((((((......)))))..)))..))))))))))..))))....)))))))))....(((((((((((((((.....((((((.((((((..(((((..........((..((....))..))......(((..........))).......)))))..))))))...)))))).....)))))...((((((.(.....).))))))((((..(((((((((...((((((..((((((.((((.(((..((((.(((((((....)))).))).))))....))).)))).(((....((((((....))))))...))).))))))..)))))))))))))))..))))...)).).)))))))............)))).))).)))))))..)))))......((((((((.(((((((.....(((...........)))...(((((...)))))..))))))).))))))))(((.(((...))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,((({{{{((((({,,,,,,{,||||||,.{(,,{{|.,}||||.|},,,...,.|||||||||}},||,})))}}(((({{{((((((({,,,..(((((({((((((.(({(((((((((((....((((((((,,(((.((.((((.(((......((((.....))))))))))).))))))))((((((((.(((((((((((((.(((((.(.((((((((.(((((((((((((.((((((((((.((((.(((.((((((((.((((((((((....((((.{((((((((((((({({.(((({{{((.(((((,.{(((....))))))))).,,||}|{{{{,|},,.{{|{|||||}|((({(((((((((((((((((.((.((...........((((((((((.(((,...(((((.....,,{.((({......(((((.((((((.(((..(((((((...((((...((.(((((..........)))))))..)))))))))))....))).))))))...))))).,.....}))),..},....))))).....))).)))))))))).((((((.(((((((((((((.(({,.,(((((.((..((((((....(((.........)))..))))))..)).)))))))).)).)).)))).,,,.((((((...)))))).))))).)))))).)).)))))))))){(((.((....)).))))........)))))))))......,})),}...||||}|||||....)))))})}},..,},,,|||.{||||||,||},.,,,.)})}}}}}|||||}}}}}}))).))))..))))))))))...)))))))).)))(((....))).......)))).)))))))))).)},.....,(({(,..,,,|.||)))}...}},,,,...,||...{{{,,(((.(((((((((((((((((((((((.((.{((.(.((((((((((((..(((((..((((...((,{{........,{(((......)))}((((((((((((((((((((((..((((((.((((((.(..(({.(((((.((.......)).))).))}))..).))))))...((((.(((((...))))).))))((((((((.((.((((((((((...(((.((((((...{({,....,((((((((((,,(({{,....,))))).....)))))))))}...(((((((.((.(((((((((((.,........,))))))))))))))))))))............((((.....))))........................,.......))))))))).)))))).)))}..((((((....(((....(((((((......)))))))))))))))).......)).))))))))).))))))..))))))))))))))..,..((.(((((..((((((((((((((((((((({{{{{{{(,{{,...|...}}}))).....,,))))))))))))))))).....((.(((.(((((....))))).))).))((((((.((((((..{{.,.{(((.(.(((.(((....)))..))).).))),)...})...))))))..))).)))((((((((((((....((((.....))))..))))))))))))).((((((..........))))))....(((((((.....((((...((((..,.|{{(((....})),|(((((((((((((((((((.(((...(((....)))...)))))))).))))))))))))))}.(((....)))..{(((((((((((......))).))))..))))}...,.,},)})))))).....))))))))))},)).)))))...}}..........((((((((((((((.{{,...||}.))),.,,..{{{((((((((,{{.(((((.....))))),,.,,.)),,))))),))}.............(((((....)))))...{{{{{{.............,,||||},....(((,,,{{,{|,,,,|||}|,|,}}}))),)),)))))))))))))....)))))))))).,}.)})})..)).)))..))))))..}.))))).).)),....)).)).)))))))))))...((((((.((((((((((....))))......)))))))))))),)))))))))))))..}}},,,(((((((({.(((((,{((.(((.....(((((((.{.((.......)),(((({(((((({...(({((.(((((..((({..(((.((((((.(.(((.....{(((((,{{..,,,|||(((((........))))}.((.(((((.(((((....))))).))))).}}..|||}},,)),.}}...,.,})).....)))))))))).)))))))))))).)},))}..)))))))......,(((((((((((.{.(((({...((..,....(((((((..,(((((((.((((..((.((((((.{((((.,{,,..((((((((((......))))))))))(((((((((.((((((((((((.(((..(((((........)))))..))).)).))))))),..{((((((...,.(.(.((((.,,...,})))).).)...}..))))))}(({.(((((...{..((((((((((.(((,.((((((....)).))))......(((((((((((((.(((..((........))..))).)))))))).))))),.})))))))))))),,.))))),})})))))))))))){{{.((((((((((.(((((((((.....))))))))).))))......)))))),))))))).)...)))))))))))).)))))))|,{,.,,,{,,,.{{||,||,,},|((({....}||{{{{|,((((((((..((({.,,{{..,..(((((.{.((((...((.((((((..(((((((((((((((({((.(((.(((.....((.((((((((.((((.{(((.((({((..((((({,((({...({,,({{{{,|,,,,,}})))),,)}},.}).))))..||,.,{......}}|||.........)),)))}.))))..)))).)))))))))))})))))),))))))))).......)))))).)))...)))))))).))))...}.)))))..}}))))..)))))))).})))))}))).)))))))...))..})))).).)))))))))))))))))))))))))).))))))))..}))).))))).}}||({(((((((((((((...,,,...((((....)))}.......,},)))))).)))}.,,)}|||}...,,,((((((........)))))).}))},...,)))))))))))...))))))},).).)))))....(((.....))))))))))))))))).}}))))))),,,((({.,....},)})),{((((((.....(((..((((((((............................................................,,{{(({({(,({({(((((((({(({,,(,(({(,(((({{.........{{({{(,({,,.....,.))),,)))(((((.{{.......,,...,(((((((((((......(((((((((((((((((((.((((((.((((...))))....})))))...)))).)))))))))))))))....))))))).)))).,}})))))..((((((((.....,(({{...(((((({...}))))))...}),)}..))))))))}))))).)}))}..))),,)))))))))).))))))((((((((...((((.....)))).))))))))(((((....)))))))))))))..)))))))))}.))))))....))))))))))).,,|(((((((((({((,{{,.(((((({,{((.(((({,(......}.})))).}},,,))))))).})))).....))))))))))|(((((......))))),.{((,{{(((((((,(({({{(((((((((((.({...}).))).)))))))){{........}|,{{,{{({,(((((((((((...(((((((,,....(((.{({..(({......}))..,.))..)))..),.)))))))))))}.}}}}))||)})},,{((,(((({(((,{,.,,,,,,|||||||||,}||,,...(((((,(((({(((({,,({((((..(((({....}))))..))))||{(((((....)))))|||,(({{{||||},(({...(({((((,.,..{{(((...,{,.{(((((.(((......))))))))},{,,,.}}...}}}))..}}}}.,,.,,,..{||,,,))}.}}}}}.,,..,.,{{,,.......}}))).,........|,,.}))|..}}.}}})))))))},.......,|||||,......(((((((.......))))))).....,{{,..,{{{{{.{{...,.....,{,,,|.}},)))))}}}}}}|(((((((((...(((({{{{{{{{{.......))..}}}}))))))...))))))))}.({(..((((.........((((...(((((((...))))))))))).........))))..)))}}},,,,))}}))))),)))}|,,{,,||}}|||}||,,{..,((((.{{.,,,,,},}}.})}}.|||,|,.}}}}||||||},(((((((.(((((((...(((..(((((((((...)))))))))..)))..)))))..)).))))))).....}..|||||},}|,}}},,........,,,,|||{{..,))))).})}))},,{||}||.|||},||||{...{,{{({.,{{...,...,.....,||||},...,}),.,,.)),})))))},)})))}))))}))))}}}{|{...,.}}},.....,,,........,|{{{,,.,|,{|{{({{,,.{||,{{{{((((.,,..,|}}||,,||,..||}}},,}}}},,}}}||,.|},....,,....(((((((((((((((..,..((((((.((((((.,(((((..........,{..((....))..,,...,..,,...........))}.......))))),.))))))...))))))..,..)))))...((((((.{.....}.))))))((((..(((((((((|,.,{((({.,((((({.,,,,.{{|.|{{{{.(((((((....)))).))).}}},...,))),},}}.{((....((((((....)))))),.,}},.}}})))..}))))))))))))))..))))...)).)|}))))))...{{{|.,...,})}.)))}}}}}}}}..,,,,....,,,{{{{{(({.{((((({...,,{{{,.,......,,}}}...{((({...})))}..))))))).}))))))){||.{||,.,))).})),.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001372163.1 NCBI
GACAGGGCCCCUGCUGGAAGAGGCGCAGCAGCGAGGUGGCGGGCUGCGU… 5705 nt 0.4943
NM_001372165.1 NCBI
AGUCAUUGGCGGAACGCGGCCUCGACUCGGUCCUUCUUCUGAGGGCCCU… 5744 nt 0.4946
NM_024082.4 NCBI
AGAGUGGGGCGCGGGCGCGCGGUGCUCGGUGCGCGCCGCCGCCCCUCCG… 5921 nt 0.5067
Summary

This gene encodes a protein which contains a vitamin K-dependent carboxylation/gamma-carboxyglutamic domain. The encoded protein is a member of a family of vitamin K-dependent transmembrane proteins which contain a glutamate-rich extracellular domain. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the PRRG3 as a shared downregulated differentially expressed gene in left ventricular tissue between animals with hypertrophic cardiomyopathy and pediatric human HCM cases, establishing its transcriptomic association with the disease in this spontaneous non-human primate model [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].