Basic Information

Symbol
PRSS22
RNA class
mRNA
Alias
Serine Protease 22 BSSP-4 Brain-Specific Serine Protease 4 HBSSP-4 SP001LA Protease, Serine 22 Serine Protease 26 Tryptase Epsilon Protease, Serine S1 Family Member 22 EC 3.4.21.- EC 3.4.21 Prosemin PRSS26 BSSP4
Location (GRCh38)
16:2852728-2858210
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022119.4
Sequence length
1383.0 nt
GC content
0.6377

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-627.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -650.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022119.4 NCBI
ACACACCCUGACCCGCAUCGCCCUGGGUCUCUCGAGCCUGCUGCCUGCU… 1383 nt 0.6377
Summary

This gene encodes a member of the trypsin family of serine proteases. The enzyme is expressed in the airways in a developmentally regulated manner. The gene is part of a cluster of serine protease genes on chromosome 16. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PRSS22 gene was significantly up-regulated in skin following ultraviolet-B-induced inflammation, with a fold change of 17.1 in human and 3.6 in rat skin [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338]. In a separate investigation of mild traumatic brain injury in rats, the PRSS22 gene exhibited a time-dependent expression pattern, being down-regulated at 12 hours post-trauma and subsequently up-regulated at 48 hours [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].