Basic Information

Symbol
PSD3
RNA class
mRNA
Alias
Pleckstrin And Sec7 Domain Containing 3 HCA67 EFA6R EFA6D KIAA0942 Exchange Factor For ADP-Ribosylation Factor Guanine Nucleotide Factor 6 D Pleckstrin Homology And SEC7 Domain-Containing Protein 3 Hepatocellular Carcinoma-Associated Antigen 67 PH And SEC7 Domain-Containing Protein 3 Epididymis Tissue Protein Li 20mP Exchange Factor For ARF6 D DKFZp761K1423 ADP-Ribosylation Factor Guanine Nucleotide Factor 6
Location (GRCh38)
8:18527303-19084730
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015310.4
Sequence length
11704.0 nt
GC content
0.4177

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3418.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3640.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3283.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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NM_001412865.1 NCBI
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NM_001412866.1 NCBI
CUCUUGGCAGGCUGGGACCUCAGGCGCACACAGGGCUCAGCUGCCCCUC… 12244 nt 0.4235
NM_001412870.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11721 nt 0.4178
NM_001412871.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11595 nt 0.4177
NM_001412872.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11505 nt 0.4177
NM_001412873.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11614 nt 0.4178
NM_001412874.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11745 nt 0.4176
NM_001412875.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11885 nt 0.4186
NM_001412876.1 NCBI
GGCAGUCCCGGGAGCUCAACAAAGAGCACGCGGCGCUGGCCGCCGGCAC… 11780 nt 0.4181
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Summary

Predicted to enable guanyl-nucleotide exchange factor activity and phospholipid binding activity. Predicted to be involved in regulation of ARF protein signal transduction. Predicted to be located in membrane. Predicted to be active in glutamatergic synapse; postsynapse; and ruffle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic alcohol exposure significantly downregulated the PSD3 mRNA in hippocampal tissue, as identified through high-throughput sequencing and bioinformatic network analysis [Du et al. DOI:10.3389/Fphar.2024.1377501].