Basic Information

Symbol
PSMD4
RNA class
mRNA
Alias
Proteasome 26S Subunit Ubiquitin Receptor, Non-ATPase 4 AF Rpn10 AF-1 S5A Proteasome (Prosome, Macropain) 26S Subunit, Non-ATPase, 4 26S Proteasome Non-ATPase Regulatory Subunit 4 26S Proteasome Regulatory Subunit S5A Proteasome 26S Subunit, Non-ATPase 4 Multiubiquitin Chain-Binding Protein Antisecretory Factor 1 MCB1 ASF 26S Proteasome Regulatory Subunit RPN10 S5a/Antisecretory Factor Protein Angiocidin PUB-R5
Location (GRCh38)
1:151254709-151267479
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002810.4
Sequence length
1319.0 nt
GC content
0.5299

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-468.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -492.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 297.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330692.2 NCBI
GUUGUUAGGCCGUCCCGGAGACCCGGUCGGGAGGGAGGAAGGUGGCAAG… 1309 nt 0.5332
NM_002810.4 NCBI
GUUGUUAGGCCGUCCCGGAGACCCGGUCGGGAGGGAGGAAGGUGGCAAG… 1319 nt 0.5299
Summary

The 26S proteasome is a multicatalytic proteinase complex with a highly ordered structure composed of 2 complexes, a 20S core and a 19S regulator. The 20S core is composed of 4 rings of 28 non-identical subunits; 2 rings are composed of 7 alpha subunits and 2 rings are composed of 7 beta subunits. The 19S regulator is composed of a base, which contains 6 ATPase subunits and 2 non-ATPase subunits, and a lid, which contains up to 10 non-ATPase subunits. Proteasomes are distributed throughout eukaryotic cells at a high concentration and cleave peptides in an ATP/ubiquitin-dependent process in a non-lysosomal pathway. An essential function of a modified proteasome, the immunoproteasome, is the processing of class I MHC peptides. This gene encodes one of the non-ATPase subunits of the 19S regulator lid. Pseudogenes have been identified on chromosomes 10 and 21. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for PSMD4 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.