Basic Information

Symbol
PSME4
RNA class
mRNA
Alias
Proteasome Activator Subunit 4 KIAA0077 PA200 Proteasome (Prosome, Macropain) Activator Subunit 4 Proteasome Activator Complex Subunit 4 Proteasome Activator PA200 Protein BLM10 Homolog HBlm10 Blm10 Proteasome Activator 200 KDa BLM10
Location (GRCh38)
2:53864069-53971040
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014614.3
Sequence length
7250.0 nt
GC content
0.4222

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2060.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2198.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2519.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((((.((((..((.(((((..((.(((((..((...))..))))).((((.........))))..))..))))).))..)))).))).....)))))))))).((((..((....(.....)....))..)))).((((((((((((((((.....))((((.((.(((((((((((((((((((.(((..(((....(((.((((((...(((((..(((.((((.((((((((((.(((.((((((...)))..))).)))))).))))))).(((((......)).)))(((((......(((((((.((......)))))))))))))))))).)))..))))).)))))))))(((((((.((..(((((.(((((((..(((((((...))))))))))))))...((......)).)))))....(((((.((((..........))))))))).(((((((..(((((((......))))))).)))))))..(((((.(((((((.....(((((....))))))))))).).)))))(((.....)))))..)))))))..((((..((((((........))))))))))((((.......)))).))).))).)))..(((((((..((......((((((((...(((....((((((....(((((...........))))).)))))).))))))))))).....)).))))))).......((.((((.(((((.((((...((....)).....)))).))))))))))).........(((.((((((((((....))).))))))).)))...................))))))))).))))))).)).))))(((((((..((((((...))))))....))))))).......(((((((((((((((((((((.((((((((..(((((((..(((((.((((((.((((((((.....)))..............((((((((...(((...)))))))))))))))).)))))).)).............)))..)))))))))))))(((((((..((((((.....(((..(((....)))..))).))))))..))).))))(((((((.((((.(((((......)))))....((((((((((((......))))..((((..........)))).....(((((((.((((..((((.(((((((((((.(.((((((..((((.....))))..)))))).).))))......))))))).))))..))....))))))))).(((((.....))))).........((((.((...)).))))))))))))))))...))))))).)).)))))))..((((..((((((((((..(((((((((((((((....))))..))))))...))).))..)))))).....))))..))))....)))))))))))..)))....))))).((((((((...................(((((((((..........(((((((....((((((((((.........))))))))))....)).))))).(((((((((.....)))))))))(((((...(((((.(.(((..(((.((..(((.(.....(((((((((((.(((((...(((((((((...((((..((.((((((((((((.(((.....(((((((((((.((....)).)))).((((((((((((.....(((..(((((..((((((((..((((.....((((...))))..))))..)))....)))))))))).))))))))...)))))))(((((..(((((.........(((((((((((............((((((.(((((((.........((((...(((((((.(((.((.(((((..((((((((((..(((((((((((.((.(((..((.(((..((((((....(((..((((((.(((.((((((........))))))..((((........))))...(.((((((.((.((((((........))))))))..)))))).).))).))))))..)))...))))))(((((....(((...(((((...)))))....)))..)))))))).))..))).)))))))))))))..)))))..)))))....)))).).)).))))))))))....))))((((....)))).((((.(((((((((((((((((((...)))))))))))((((..(.((((....)))))..)))).......((((((..((((((((........))))))))))))))........))).)))))))))((((((((............((((((((((...(((.(((((....))))).))).....)))))((((...((((..((.(((....))).))..)))).)))).((((....)))).(((((....((((....))))..)))))..((((((((..((...((..((((((.((((.(((.(((((.((((((.((..((.((((((((.(((((....(((((.((((..((((.((((((..(((((((.....(((((.....)))))......))))))).....(((((..(......)..)))))((((((((((.(((((.((.(((((.........))))).....)).)))))))).))))).)).)))))).)))).(((((..........))))).(((((((...))))))).((((....))))..(((....(((.(((((..((((((((((.....))))))..)))).))))).))).....))))))).)))))...)))))....))))))))))..)).))))))(((....))).((.((((((((((((.......((.(((((........)))))..))................(((.((((((..(((((......)))))))))).).)))......)))))..))))))).))((((((......(((((.((.((((...((((...)))).)))).)).)))))....))))))...((((((((((....(((((..((((((.....)))))))))))(((((.......))))).((((((((..((.((((((....((((..(((((((.((((((............(((((.((((((.((((...(((((..((.....((.(((...((..((((((.(((..(((.(((((...(((........))).(((((...)))))...((((....((((.(((((((.(((((.....((((((((((..(((......((((((..(......)..))))))(((((......)))))(((((.....)))))((((..(((((((((.........))).))))))..))))...((((.((........................)).))))...)))))))))))))))))).)).........))))).))))....))))........((((..((((((((........((((.((...)).))))(((((.........)))))((.(((........)))))..................))))))))..))))((((((.(....)))))))....(((....(((((((((.((..(((((((.((.((((((...))))))...))...))))))))).)).)))).)))...)))(((((((...((...))...)))))))..................))))).)))..))).))))))..))...))).))....))..))))).)))).)))))))))))))))))...........((((((...)).))))...........)))))))..))))....))))))...))..))))))))......(((....)))...)).))))))))..........((((((((.(.(......).).))))))))..)))))))).)))).))))))..)).)).))))))))((((((((.((...(((((......))))).))))))))))..)))))......(((((((.((.......)).)))))))....))))))))............))))))).)))))).(((((((..((((.....))))..))))))).......((((((((......))))))))..((((.(((...(((....))).))).)))))))))))))))..........((((.(((((.(((((((((........)))).........((((.((((((((...)))))))).))))))))).))))).))))...))))))))))...)))))))..........(((((((((((.(((((.......))))).)))).....)))))))...........)))...))))))).((((((..(((((((...)))))))..((((.((((((((((.((((((.......)))))))))))))).))))))..)))))).)))))))..))))(((..(....)..)))..)))))))))..)))))..)))....).))))))).........).)))..)).))).))).).)))))..)))))........((((((((((((.((((((...........................(((.((((((((((...(((((..((((.....((((......((((((((.(.(((((......))))).).))))).......)))......)))).....))))..))))))))))))))))))....(((((........(((((...((((((.((((....))((((...))))(((((((.((((((..(((((((...............)))))))....))))))....)))))))....)).))))))))))).......)))))..)))))).))))))))))))))))))))).(((((......)))))..)))))))).(((((((((...)))))))))........((((((....))))))..((((.((((((..((((((((((.(((((((.(((.(((((((((.(((((((((((((.........)))))))).)..))))))))))))))))((((((((((.(((((((((((((((((((........)))))......(((((((.........)))))))...((((((.....(((((((.(((((......)))))((((.....)))).(((....)))..............))))))).....(((.((((....(((((((((((.........)))))))))))..))))...)))...((((((((((((((...(((.(((((((..((....))....))).))))..)))))))).))))))))).........((((((((((..(((.....))).....))..)))))))).))))))............)))....))))))))))).....(((((..(((..((((((....(((....(((....)))....)))..))))))..))).........)))))..((((......))))......)))))))))).........((((((.((((((((((((((((((((..(((((...))))).))))(((((((.(((((....((((((..(((..((((.(((....((((((((.....(((((.(((((.......))))).....)))))...((..(.(((((..(((((..........((.((((....)))).))((((((......(((((..((((((((...((((...))))....))))))))..)))))........)))))))))))))))).)..))))))))))...))).))))...)))..)))))))))))((((((((.......((((((...)))))).......))))))))...(((((....))))).((((((((..((((((.(((((((((((.(......((((((..(((.......)))..)))))).....))))))))))))..)))))).....))))))))..)))))))..(((.((........))..)))(((..(((.(((.(.....(((((((((.......)))))))))).)))..)))..)))..))))))))))))...)))).))))))..............)))))))..(((((((.......((((((((.(((......(((...((((...))))..))))))))))))))((((((((.....))..))))))....((((.....))))...((((((.((...)).)))))).......))))))).....(((..(((((((((((((.((....((((((.............(((((((.((((((.......((((((....))))))....))))))..)))))))(((.(((((((..((((.(((...))).))))..)))))))..)))(((((....((((((.((.........(((((((((((...((((((.((...((((((((.....))))))))...))........(((((.(((((..((((.(((((((..((((((...........((((.((((.(((((.((((((........................))))))))))).)))).))))..........))))))...))))))).))))...)))))..))))).((((....))))))))))..))))).((((.(((......(((((.(.((...........)).).))))).....))))))).....((((((......))))))....))))))........)).))))))..((((...))))))))).((((.....((((((((....))))))))..))))..)))))))))))))))))))))..))).))).)))))))...))))))))))..(((((.(....)))))).((((.((((((..(((((....)))))..)).)))).))))....(((.....))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((((((,((((..((.{((({..((,(((((..((...))..))))).||||.,....,..)))}..)),.}}))},}}..}})}.)))}},,.)))))))))).((((,.{{.,,,({{.,.|{,,{||,,||||,(((((((((((((({({{((,{{((((,((.((((((((((((((((((,((((((((((((.{{{{{((((({..(((((..(((.((((.((((((((((.(((,((((((...)))..})),)}}))).))))))}.{((((......)).))}(((((......{((((((.((......)})))))))))))))))).)))..))))).,}|(((((((............)))))))|||||}.{{(((((...)))))))))))))))))))}}||{{{,.|}|||,...(((((.((((..........))))))))).{{{{{{{..{{((({(...,,,|||||||,|||}|||..(((((.(((((((.....(((((....))))))))))).).)))))|{|,...,))),,|{{{.(((((.(((...((((((........)))))).,.))).))))).||||,,,.,,|{{{{,|||.{{{||,,}.}|||}},,,|||||}..,,}}}....{{{{{{...,{{{{{..,...,,,,,))))).)))))},{,{((((((.((((((.....(((,,,,{....((.((((.(((((.((((...((....)).....)))).)))))))))))..,,,,..,(,(,((((((((((....))).)))))))}))))))...)))))))))))))))))))))).))))))).)).)))){((((((,,((({{,...,})))),...))))))}....,,,{(({(((((((((((((({,...((((((...})))))(({(((..((,,...}}.,)))))}..,||.,,.,,,..{{{{{..((((((((...(((...)))))))))))....}))))....{(,{(((((.{(((((((....{{{{...)))|((((......{||{{{{|....},,...,,}}}..}})},.......{(((((.((((.((((({({({.(((((......)))))..,.{(((((((((((......)))}..((((.,,.......)))).....((((((({((((..((((.(((((({((((,(.((((((..((((.....))))..)))))),).))))......})))))).))))..))....))))))))).(((((.....))))),.,......((((,,,...}),)))}))))))))}}}}..,}||||||||...,)))),,.,,))}}}}})))).)))))|{{.((((({{(((....}}}}..}))))).))}.},}},.)))))))).))))))})))))),..})))))))))}..)))..,.))))),((((((((.,{..,.....,,,,,,,,((({(((((,..,......(((((((,...((((((((((.,.......))))))))))....))}}}))).(((((((((.....)))))))))(((((...((({{.{,(({,,{{|,|{,|{{{,{,,.,{(((((((((((,(({{{,{,{({({{{{{...{{{{,,||.||||||||{{{{.{||,.,,.,,{{{{||||||||,,,.,}|||}|,||||{{((({{{,,..,{{{..{{{{{..{((((({(..(((({{(((({.{|||||||,,|}}}.,))),,,.})))),)))),)})}}}}||.,||||||}|,||||{{{{{{,,.,||...((((((({((({,{{,.....,,({((((,(((({{({((,....{(((,.,,(({{{{|||{{,||,|..||,,{|||||||{{,.({{{{{|{{{,.{{.{((..,{.((({,{{,,{{....||{..{({(({,{{{,{((((({{,,....}}}|||..((((........)))}...,.{(((((,((.(((({{,,,,,,..}}}})))),,}})))},}..,}})))))|,|}}},,,||||||,|{{{,|{{{{{...,,,,((((.(((......))))))).,||}.}}..}}}.}}))))}}}}}}),,))))),}}}}}),,|,},}}.}},}|||{||||}}|{,,,|))|{|||,,,.}))},||||}||||||{((((((((((({...}))))))))))},|,..|,||||,,..})},},,}}},.......{{{{{{,{((((((((........))))))))}})))},,.},}}}))}||||},}|||((({{{{{...,,.,{{...,|||,||||||,.(((.(((({....})))).)))...,.,,,,,{(((...((((..((,(((....))).))..)))),))}}.((((....)))).{|||,,,||{(((,,..})))}})})}}||||||||{{..{(,.,{{,,((((((,((({.{{(,{,(((,((({{{,(({{((,{{((((((.(((({...,{((((.((({..((((.((((((..{{(((((.....{((((.....})))}...,,,||||}}|,,...,|||,..({,,...,..}))))||||||||{{,{{{{{.||{(((.,..}}}|{{{{{|,,.,}.})).})))))),.))))),}},)))))).)))).(((((.,.......,))))).(((((((...))))))},((({..,})))}..{{{.,,.{({.(((((..((({((((((.....)))))).,)))).))))}.,)),|,.|}|}}}}}.}}}}}...))))),.,,)))|||||||,.}},||||||((((,,{{{{..,{(({{,.,,,,{,.......,,.{{{{{.....,}})))))}}}}...............{{{(,.{{{{{.|{{{{{{{{,..||||.,|||,.,.)))...}}|}||,{{{|||||||,|{(({,,,......(((((.((.((((...((((...)))).)))).)).))))).,,,}}}}}}}|,|{{,||||{|...,(((({.,((((((.....)))))))))}}{((((,{{{{..{{{(((,,.||||||||}.,}}|||,{|||{(({.,(({||{{{,((({,.,.....||||{|||{.{{||,,,|{{{,,,{{|{(,..||,,..||,||{,||{,..{{{|||.|||,|||||,,|({{..|||,...,.,,)}}.{|||,..,)))),.,{((({{{{{{{((((((((((,(((({..,,.{{({{{{{{|.||||.....,{{{{,,..{|,,.{{|{{||||||(((((......))))}|||||}}}}}),}))||||..|{{|{{{((.,,....,.})),}})))}..||||{{..{{{.||..,,.,}}}}}}},,..........),))})}},})}))))}))))))))}),},.......,,})}}}}},,,.....||....}}...((((..((((((((,,,..,..((({.,....,),))}}{((((,|.....,.)))))((.(((.......,})))),,..............,,))))))))..))))((((((.{....}))))))|,,.(((.{,.(((((((((.{{.,{{{{(({,,,.((((((...)))))).,.}}.,,}}}}))})).))}}})).))).,,}}}(((((((...((...))...)))))))....,,,..{{||||..,||||||}}|..,,|.|||}}}..})}|.)),.}}........}}}||.}}}}.|}}||}}}}}||||}|||,,..||,,,||||{{,,,,},.}}})},..,,...|||}},,||.....,...,)))}))}}})))}}}}})))|.......||,||||||,,.||,{|||,|{{.,..{{{{,,||||||||.,}||}}|||||}.}}||||||...}}}|}}}.}}}),}||}||,.,,.}}.||||||||((({((((..,...(((({......|)))}.|}}}}}}|||,,|}}||......{((((((,,{..,,},,)).)))}}))}...})))}})),,..........))))))),))))}}.,((((((..((((,...,))))..))))))),,},},.((((((((......))))))))..,(((.(((...(((....))).))).)))||}|||}|||}}..........|(((|{,,,|}|||{,(((({{{{{{..||,|.........((((.((((((((...)))))))).))))}}}))})))))})}|}|||}|||},,,,,.,,||||,............((((((({(({.,..|||....,,||||...,))}}.},))))))).....,,..,|)}}...}}}}}}}.{(((((..(((((((...)))))))..((((.((((((((((.((((((.......)))))))))))))).)})))).,)))))}.)}})))).,)))){({..{....),.}}}..}})))}}}},,||||}.,},.......}))))))...,,....},)))..}|.,}}.||},}.|}}}}..})))).....,,,,{(((({{{{||.((((((,.....,,,|,,|,,||||,,,,,,.,(((.((((((((({..,{((({..((((.,,,.,{{{.....,|||({{{(|(.((({(,,,...})))).,.))))),,,,))..},...,,,}})),,},.)))}..})}))))))))))))))}.....(((((((((.((.........(((((({{,.{{.(((.{({({{...}})))).,.))).)).},........))))))........)).))))))))).,,)}}}}||}}.....,.,....,},,,,.,|,||{|...,|||,,)))}}}.}}})))))))}}})})))}}}.(((((......)))))..}}||||||,,{{||||||,..)))))}}},.......|((((({....))))))}}{{{(,((({((,,{((({{((({..((((((((((.(((((((((.((((,((((((((.........)))))))).}..))))))))))))))))((((,,.....}))),,}}}}))).,,......,{((((,(((((({{{(((((((.........)))))}}{{{,.{{{{{{{,.....},,,(((((..((((({.{(,((((((({.,{({{({,,{{|||.....................,,...(((.(({{..,{{((((((((((,......},))))))))))))})}))...}))...((((((((((((((...{((.(((((((..{{....}}....))),}))).})}}))))).)))))))))....,))))))))|,,|||,,(((...,,|},.,,,,,...|}}|))||||.,||..........,,,,,,.......},))))))..)))))}..,}}}|||({{{.,.{{{((((...{{,....,,,.{{{{||||{|||{,{{{{{{.{{{{,|{{{{{...((((......)))).}...,,,(({{.({((({..{{{.,,(((({(((((......{((((.((({.,(((({(({||.{{|||(({{({{.((({(({....}})},....))).)))}.,,)))))}...)))))}.,,,{(({,{{{{,,.....}))))}}}{(((((({{(((..(((((({(((({.,((({,.....,,.((((,,,,||||.|,((((((......{((((,.((((((((...((((...))))....))))))))..)))))........))))))..{{,((({.{{{,,|{{|.(((({{,,{.|}|}.....|,,.,|,}},..,||((((((((.......((((((...))))))...,,..})))))))...(((((....)))))...,,,,,.....||||,.,|||,||}}}|}}}}||||}}}))))}}),,.,,,,|||,,}}}},),))}}})).}))),)))),.,,,))))}}})))..,}}}.,))}))).)}}},|,........{,.....{||.,|||.|||.......,||||||||},.,,{.||||,||||{{|.......)))))))}))),))}))))))..))),}}})}})))}),,,.....,}}||||{{{{{{...,..,,}..{(((((((,({{......,,{.,.,.,.....,,,..))})))))))))))..}}}}}}}}}...))))))),)}}}.((((.....)))).,,}}}}}}})}.)))))|,...........||||,,,.....{|{..(((((((((((({.((,,,,{{{{{|,|,,.........,{{{{{{,(((({{.......((((((....)))))).,..))))))..}}}})}},,,,{{{{{{{,,{{({.,{{,,,}}|,||||,,||||}||,,,,|{{({{,,.,|((({{|{{,..(({{{{({{{,.,,}}}},,|||}|},,,,..{(((((((.....}))))))}...||,,{{{.{{((.{({(((,,..,)}}}}})))}|,,|{{|||..,..||||,.{{((.(((,,(((({,({{{{{,,,........,.,,....,,},,)))))}})}}),)))),}}},...,,,,,,})))}}}..,,,|,|||||}},,,}))))},,}}})}}||||...||||}||||,,..,,))))..|}}|,,.,,}||{{|{{|{|{,....}}}}}}.))}},}})}},,,,,}}}|}||,....{(((((......)))))),},,,,,}))},,.}},,{{{{||{((.(((((...))))).})).|||{.....((((((((....)))))))).,)}))..}))))}))))))))))))))),.))}.))).))))))}...)))))))))}..(((((.(....)))))).((((.(((((({,(((((....))))),.)),}))).))))....(({.....))),})))}}}}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014614.3 NCBI
AGAGCGGCCGCUGCCGCCGCCAACGAACUGAGAGCCGCGUGGGGCCCAG… 7250 nt 0.4222
Summary

Predicted to enable lysine-acetylated histone binding activity; peptidase activator activity; and proteasome binding activity. Predicted to be involved in DNA repair; proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process; and sperm DNA condensation. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.