Basic Information

Symbol
PSRC1
RNA class
mRNA
Alias
Proline And Serine Rich Coiled-Coil 1 DDA3 Differential Display And Activated By P53 Proline/Serine-Rich Coiled-Coil Protein 1 Proline/Serine-Rich Coiled-Coil 1 P53-Regulated DDA3 FP3214
Location (GRCh38)
1:109279545-109284107
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001032291.3
Sequence length
1720.0 nt
GC content
0.5628

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-647.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -678.73 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 432.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005290.4 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1614 nt 0.5570
NM_001032291.3 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1720 nt 0.5628
NM_001350237.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1998 nt 0.5701
NM_001350238.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1707 nt 0.5589
NM_001350239.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1672 nt 0.5580
NM_001350240.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1667 nt 0.5579
NM_001350241.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1725 nt 0.5571
NM_001350242.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1661 nt 0.5569
NM_001363309.2 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1794 nt 0.5624
NM_001394002.1 NCBI
GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… 1709 nt 0.5617
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

This gene encodes a proline-rich protein that is a target for regulation by the tumor suppressor protein p53. The encoded protein plays an important role in mitosis by recruiting and regulating microtubule depolymerases that destabalize microtubules. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Apr 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PSRC1 mRNA was up-regulated 2.95-fold in bone marrow cells 6 hours after 6.5 Gy whole-body ionizing radiation. This differential expression was validated by RT-PCR, showing good agreement with microarray data, and the gene is noted to be activated by p53 within the broader radiation response involving DNA replication/repair and apoptosis pathways [Dai et al. DOI:10.1080/09553000600857389]. This up-regulation occurred alongside other p53 pathway genes, indicating its role in the transcriptional response to radiation-induced DNA damage within the investigated biological system.