Basic Information
Symbol
PSRC1
RNA class
mRNA
Alias
Proline And Serine Rich Coiled-Coil 1
DDA3
Differential Display And Activated By P53
Proline/Serine-Rich Coiled-Coil Protein 1
Proline/Serine-Rich Coiled-Coil 1
P53-Regulated DDA3
FP3214
Location (GRCh38)
1:109279545-109284107
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_001032291.3
Sequence length
1720.0 nt
GC content
0.5628
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-647.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-678.73 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
432.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… | 1619 nt | 0.5571 | |
| GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… | 1672 nt | 0.5562 | |
| GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… | 1805 nt | 0.5634 | |
| GAUUCCCGGGACUAGGUUGCGGGAGAAAGCCUGUUGCGUGGAAGAUAAG… | 1715 nt | 0.5627 |
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary
This gene encodes a proline-rich protein that is a target for regulation by the tumor suppressor protein p53. The encoded protein plays an important role in mitosis by recruiting and regulating microtubule depolymerases that destabalize microtubules. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Apr 2014]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the PSRC1 mRNA was up-regulated 2.95-fold in bone marrow cells 6 hours after 6.5 Gy whole-body ionizing radiation. This differential expression was validated by RT-PCR, showing good agreement with microarray data, and the gene is noted to be activated by p53 within the broader radiation response involving DNA replication/repair and apoptosis pathways [Dai et al. DOI:10.1080/09553000600857389]. This up-regulation occurred alongside other p53 pathway genes, indicating its role in the transcriptional response to radiation-induced DNA damage within the investigated biological system.