Basic Information

Symbol
PTCH1
RNA class
mRNA
Alias
Patched 1 SLC65B1 BCNS PTCH Protein Patched Homolog 1 NBCCS PTC1 PTC Patched Homolog 1 (Drosophila) Patched (Drosophila) Homolog Patched Homolog (Drosophila) BCNS1
Location (GRCh38)
9:95442980-95517057
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000264.5
Sequence length
8662.0 nt
GC content
0.5236

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3081.74 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3233.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2345.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.(((((((...((((((((..((((.(((((((((((((............(((...(((.....))).....)))((((((((((((((.(((((((((.((((..(((.((((((.(((........)))((((((((.(((((((((..((((.........((((..(((((.((...(((((........))....)))(((.(((((..(((.(.(((...(((((.(((.(.(((((.((((((...(((((.(((.(((...((((....((........))....))))...))).))).))))))))))).)))))).)))...)))).)...))).))))...))))).)))((((((((((((((((((.((((((((((((((..((((.(..(((((((.....((((.(((((((((((((...((.((.......)).))....))))))))))))).)).))....))))))).).)))).)))))))))))))..).)))))))....))))......)))))))...)))))))..))))...))))..)))))))))..)))))))).))))))...)))..)))).))))))((.((((..(((...((((.((((..((((..(((....)))....)))).)))))))))))..)))).))))).)))))))))))))).((((.(((.(((((((........))).)))).)))))))....(((...))).(((((.((((...(.((((.(((((.(((.(((((..(((((.....(((((((((((((((.....((((.(((((.((((.(((((...)))))...(((.(((((.((((....)))).))))).)))(((......)))((((((((((..(((((((..((...))....)))))))((((((((.(((((..((((((((((((..((((((((....((((...(((((((.(........)..))))))).)))))))).))))..))))).......)))))))..))))).))))..))))((((((.((.(((((.....))))).)).))))))))))))))))...)))).))))).))))((((.((((((((((((((((...........)))))..((((.((((...((((......)))).)))).))))((((.((........))))))(((((.((..........)).))))).((((((((...(((...((((((((((((((..(((((.((..(((...((((((.............((....))...(((((((((((((((((((..((.((.........(((((((((((..(((..(((((((.((((((((((....)))((((.(((((......((((((........))))))((((((((((.((((....)))).)).)).)))..)))...(((..(((....)))..)))...))))).)))).......(((((((......((...(((((......)))))...))))))))))).))))))))))))......)))..)))..(((((........(((((((..((((((.((((((((.(.....(((...(.(((.((......)).))))...)))..(((..((..((((..........)))).))....))).).))))))))..)))))).....(((((((((((((((((....))).))))).....))))).....))))...))))))))))))(((...(((((((.(((....(((((....((((((......(((..(((.........((((((........))))))..........)))..))))))))).)))))))))))).))).((((((((..(((((((((.......((.(((..((((((((((.((.((.((((((((((.((((((((.(((....(((....))))))...)))))..(((.....)))...))).)))))))))).)).......((((((((((..(((((((.(((((((((..((.(((((((((...)))).(((((((.....))....)))))...(((.(((..(((((((((.(((((....(((.((.(((((((..(((..((((((.((((((.((....(((((((((((((...............((((...(((.(((...(((((.(((.((((((((......)))))))).))).)))))))).))).))))..((((((((....((((..(((((((((((..(((((((((.(((.......(((...))).......(((........)))((((((((.....(((((...(((((.(((..(((.((......)).))).))).)))))...)))))....)).))))))(((((.....)))))))).)))))...((((((((((((.((((....(((...(((((((((...................................)))))))))..))).......))))...))))))..))))))...((((((((((...((((((((.......(((..(((((.((.....(((((((...(((((.((.(.(((....))).).))))))))))))))((((((...((((((((........((....))..))))))))..)))))))).)))))...))).......))))).))).....)).)))))...))).))))....)))...)))))))).((...)).........))))...)))).))))......(((..(((((....)))))..)))....((((....)))).........)))))).)))))))((((........((.(((((((((.((........))..(((((((((.....(((((((((((((....)))).....((((.......))))((((....)))).....(.(((((((((.(.((......((...(((.(((...(((((.(....).)))))((((...))))....))).)))...)).....))).))))))))).)...........))))))))))))))))))..(((.....)))..(((....)))...))))))))).))....))))........(((((....)).)))((((((((.....(((((....((((...((.(((.((((((.....................)))))).))).))...))))...)))))..(((((((((...(((............))).))))))))).))))))))(((((...........)))))......(((....))).......)).)))))).))))))(((.((((.((((...(((((((...((((((((((((((((((((((((((((.....((((.(((..(((((..(((((..(((....)))))))).(((....)))(((((((((((((((((..(((((........))))).........(((.((((((((.(((.(((...............))).))).)))))))).))))))))(((((......))))).))))))...))))))....((((((((((((((.....)))..((((...(((((.((.......))......(((((...(((((((((((..(((((.((....((((....(((.....................)))...)))))))))))...))))).))))))..))))).............))))).)))).............(((((((((.((......)))))))..))))..(((..........)))((((((.((..(((....)))..))))))))((((.....))))..)))))))))))((((((.....))))))..))))))))))))((((.((......(((((((((((....))))))))))).(((((((.((((.((((....)))....).)))))))))))......((((.((((((.....(((((((...)))))))......))))))..)))))).))))...((((..((((((.(((((........)))))..))))))..)))).(((((..(((((((......)))))))..)))))..((((((.(((.(((((((((((((((((....))))))..))))).)))((((((((((((((((......)))((((......(((((((..(((.((...)).)))..(((((.((((....(((((.((....((((((((((((((.((((......))))....(((((((((.(.((.((((...)))).))((((((((........(((....)))........))).)))))(((((..((...(((....))).....))..)))))((((((((.(((((...)))))...)))...)))))(((...)))).))))))).))((.((((((......))))))))...)))))))))))))))).)))))....((((((.((((.(((((((.......((....)).........)))))))..........)))).).)))))........))))))))))))))))....))))))))))).)))))).)))))).))))))...(((((..((((...(.(((.....))).)....))))..)))))...........(((((((((..(((((((..(((...((....))(((((......)))))......(((((((....))))))).((((((((((....(((((...(((.(..(((.(((((........(((((......)))))(((....)))((((..((((....)))).))))..((((((.((((((...((...))..(((((....((((((.((((((((((((.((((....))))..))))))))))))..(((.((((.(........).)))).)))...........(((((((((.....))).)))))))))))).....))))).)))))).)))..)))))))))))..).)))(((((((((((((((......))))......((((......(((((...((......))...)))))....)))).((((...(((((((((((.((((((((......(..(((((.((.((............))))...)))))..)))))))))..((((((....((....(((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))...))))))))..)))))).))).))....))))......(((.(((((((.(((((........))))).))))))).))).)))))))))))....)))))...))))))))))(((((....(((((.....)).)))......(((((.....))))).(((......(((((((((.....))))))))).....)))...(((((....)))))(((((((...(((...(.((((((((((((....))))))).(((.(((((((....))))))))))(((((.((((....)))))))))..(((((...)))))........(((((((...))))))).....))))).)))).))))))).))))))))...)))))))....)))))))))...))))))))).((((((((((((.(......).))))).)))))))......)))))))........)))))....)))))))..))))))))))).)))).))).(((.(((((...)))))))))))....))))))).))...)))))))).)))))))))..)))))).....))))).)).)))))).......))).)))....(((((((.(.....).))))..)))..))))...))....)))))))).(((((.(.((......(((.(((.((((((.........))))))))).)))......)).).)))))..)))))))))))).))).))((((........))))(.((((((..(....)..)))))).))))))))))...))))))))))).......)))))))).........)).))..)))))))....))))))))..))))......))))))..))))))))))..)).......((((((.(((((((((...)))))((((......)))).........)))).)))))))))))))).)))).....)))..))))))))...(((.(((((.((((..((((((.....)))).))..)))).)))))...))).....((((((((.............((.((((.(((.((..(((((.((...(((((((((....((((((...(((..(((((((......(((((((((((((((.((((...(((((...))))).))))))))))))...(((((((((..........((((.(((((........))))).)))))))))))))((((((((((.........((((.((.((((.((.(((((((.(((.((...(((((((((((.....(((.(((((.((((....((((...((((((.((....)).))))))))))..))))))))).)))((((((((..((((...)))).((..((((.(((...(((...(..((..((((((...))))))..))..).)))..))).)))).))(((..(((((.(.((((..(((((((((((...))))).)))))).....((((((.((((.............)))).....))))))..))))..).))))).))).......(((......)))........))))))))..........)))))))))))))))).))))))))))))).)).)))))))).))))))))))))).((((....))))(((.((..(.((((((...)))))).)..))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))..)).)))))))))....(((..((((((.(((........))).))))))..)))..))))))))..)))))....)))))).)))))))))))))))))))...((((.......))))...)))))..)))))..))).)))))..)))).)......)))).))).))))))))))))))).........))))..))))))))...)))).))).)))))).))))..((.((((((.......)))))).))(((((.(((.((((((((((((..((((.............))))(((((..(((((....))))))))))((((.((((((..........))))))))))(((((((((......((((...(((.(((...(((........)))....)))..)))..))))......)))))))))..((.((((((.........(((((((..............((((.((((..(((((((.(((........))).))))))).....)))).))))..((.(((((((..((((..(((......(((((((............(((((.....((((....)))).(((((((.......))))))).((((((((((((((.......(((((((.....)))))))....))))))))))))))..........((((..........))))....(((((..(((...)))..)))))(((((((.(((((.((((((.(........).))))))..)))))...........(((((....((((.(((((..((((((.(..((((((((((.(((.((((((((..((((((((((((((....)))).)))))))))).))).....((((...((((((((((((((.((((((......(((((.((((((.(((((((...............((((((.....((.((((...)))).))))))))...((..((((((((....))))))))..))))))))).)....))))).))))).......)))))))))).)))..))))))).))))...(((((....)))))......)))))))).)))))))...........((((((...))))))...)))..).)))))).))))).))))....))))).((((((((((((.....((.(((((.....((((.((((((...(((((((...))))))).)))))))))).....))))).))...)))))))))))).........)))))))..)))))))))))).....))).))))..)))))))))........................))))))).........))))))))....((((((((.............))))))))))).)))))))))...))).)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((({((((,(((({((,,.((((((((..((((.(((((((((((((.............,,,,.,((,.....||{{{{,||.((((((((((((((.(((((((((.((((..(((.((((((.{((,.,.....}||((((((((.(((((((((..((((.........((((..(((((,{(,,.((,((........}}...,|||{({.(((((..(((.(.(((..,{((((.(((.(.(((((.((((((.{,((,,{.|||}{{({,{{{({,.,|{{,.{,.{{.||..{,||}}..,},),))}.))))))))))).)))))|,)))...)))).}...))),))))...))))).})|{{{||{||{|||||||||.{(((((((((((((..((((.(..(((((((.....((((.(((((((((((((...((.((.......)).))....))))))))))))).)).))....))))))).).)))).)))))))))))))..),))))))),,,.)))).....,))))}))}..}})))))..))))...))))..)))))))))..))))))))}})))))...)))..)))).))))))((.((((..(((...(({((((((..((((..{,(,....}}.,..)))).)))))))))))..)))).))))).)))))))))))))).((((.(((.(((((((........))}})))).)))))))....(((...))).{|{{(.(((((((.((((((((((((....))),,,..(((((....(((((((((((((((.{{..((((.(((((.((((,((((({{{|||||{..(({.,{{|{}|||{}}}}))|||))}||{|||({{.....,||},{{|||{{{,.,|||||||.|||,,,||...,|)))}||((((((((.(((((..((((((((((((..((((((((....((((...(((((((.(........,..))))))).)))))))).))))..))))).......)))))))..))))).))))..))))((((((.((,(((({.....})))}.)),)))))))})))))))}...)))).))))).)))){(((,{{(((({{{{{|,|||.........(((((,,((({,,.,,,,....((((({{{{{,|,.,,},}))}(((((.((........))))))},|||}}|(({{{{.,{{{{,,,{,.,{{{|{,,{|,.|||}|.((((((((((((((..(((((.((..(((...((((((.............{{.,,,|,.,.{((((((((((((((({{{,.{{,{{,....,,,{(({{{{{({{{...,({{,((((.{,,.{((((((({(,.{{{{(((,{((({,,....{{((((,.,,{,..}}}}}},,,||||{||,||(({,,.,,,)}))}{|,|||{,||}....,(,{(({....,|..{|||..{{||||{|...{{|{|||..{{(({,,{{{{{((((((((((.,{{.....,,},...)))))))))}..,,{}||||||||.||||||||||..(((((.......{(((((((..((((((.((((((((.{.....{((.,.{.(((.({......}).)))|,,,||}..{{|..||,}{|||.,,,......,})).,}.,}.))}.,.))))))))..))))))....,((({(,(({{(((((((....)))}})))),}.,.)))),.....,}},..}))))))))}}}},||,..|||||{,.{,,....,{{{{,...,{||,,},,,}}}||,,|,|}}},..,}}{||,||},,,}|,.},}|||{...{{....}},,,}}|}}}}|},|}}|||||||}|,|||,{{{((({{..{{{{(((((,,...,.{{((({({,{{{|{{{||,{|}{{.,{|||||||{.{{{||||||..{....{||..,,))).))},,)))))..{{{.....|||,,,|||.,}}}}}}}}}.||.,.,,{{(({,(((((,{{((,((,,{((({{((({....{((((((((({{{{{.{{(((((.,{{,{.||{{{{|||||...,((,(,,..{{{,||||,,((,,,...,||,.{,{((((((({.(((.{((((((.((((((.((....(((((((((((((.........,,.{,.{(((...(((.(((...(((((.{((.((((((((......)))))))).))).)))))))).))).))))..((((((({.{{{..((..(((((((((((,.(((((((((.((((..{{..(((..,||}.|,....(((........)))((((((((..,,.(((((...(((((.(((..(((.((......)).))).))).)))))...))))),,..)).)))))).||{|,,,,},,)})))).)))))...((((((((((((.((((....(((...(((((((((.....{,......,,..,,.....},.........)))))))))..))).......))))...)))))),,)))))}...(((((((((({{.((((((((.......(((..(((((.((.....(((((((...(((((.((.(.(((....))).).))))))))))))))((((((...((((((((.....,..,,....),..))))))))..)))))))).)))))...))).......))))).))).,}..))})))))...))).)))}..,,)}}...)))))))).}}..|}}.,,......))))...}})}.))))......(((..(((((....)))))..)))....{{{{....)})}.........)))))).))))))){((({{......((.(((((((((.(({{{{...{{|..(((((((((.....(((((((((((((....)))).....((((.,,,...}},)||{|....}}}}.....{.(((((((((.(.((.....,,,...|||.|||...(((((.{....).)))))((((...}))}..,,}}|.,|||....,,...))}.))))))))).)...........))))))))))))))))))..{||},}}}))}.,(((....)))...))))))))).))..},}))}....,...|(({(,...,},|||((((({{{...,,(({{{...,||{{...,,.{{|,{|{{{(,{,...|},,..,{{{{....,}}}}).,)),)}...))}}.,,|||||,.(((((((((...(({...,........))}.))))))))).))}}))))|||{(........{{{||,}}......}.))})),,,..,.}}.)).)))))).))))))},|}||||}||{{...{,{||||.{{((,,,,|}||,,,,,{{(((((({{{{....,.,(({..(((({{..|||(((((..(((....))}))))|{(((,,,,||}||,.((({(({,.(((({((((.(((((((..({{(.....,||||(((.((((((((.(((.(((...............))).))).)))))))).)))((((((((.((((({(({(...}},)}}}.)))))...)))))))).......((((((((({.,((((...(((((.,,.....,.||......(((((...(((((((((((..((((,,(,...,((((....(((,,.....,,....,,...,,.)))...)))))))))))...))))).))))))..)))))..|,.....,,..))))),)))).............(((((((((.{{......}})))))..))))..{{(...,......)))((((((.{{..(((....)))..})))))))((((.....)))),))))),,)))).((((((.....)))))))}|||{{..,............))),}(((((((((((....)))))))))))))))))).)}||,|,}}}{|}||||{{,||||||.,.}}},{,,,...||||,||}}}}.}}.}||||||}}}}))))),,}}}}}}))))))..))))}}}))))...((((..((((((.(((((........)))))..))))))..)))).|(((({{,{{{{{{,,,,,,}}))}}}.}))))),}|(((({.{||}||{|{{||||{||||||}.,{||||||,,||}|}{||}((((((({(((,{(((......))){(((,.....,|||||{}}|{|.||}}},).))).},||||}||||,},.,{((({((...,(((((,,({{,,.,.((((......)))).,...,,,|}||||..,|}||||...,,,.,))}})))))..}}}}}...,,.,}},,)}}}..}}}))).)))))))|||},||}.,(((,...|}|{{({((({{{{{(((((((((.,,,,((.{{.||||.....}})).)).)}...}.))))))))},.|||,((.((((((......))))))}}.|||||||,|}},,}))))}))}||,...|||,(({{(((.(((((((.......,(,...}),........)))))))...,,},}|.||||{|.,.,,,.....{{{|,,,,)))),}}}}||....,))))))}}),|||||||{||}}},.||,,|{,..(({{,.,{{{{..,|,|||,,,,.}}}.}.,..)))).,})))}...........(((((((((..(((((((..(({...{{....}}(((((......)))))......(((((((....))))))).((((((((((....(((((...{((.{..((,{(((((.,.,,...(((((......)))))(((....)))((((..((((....)))).))))..{(((((.((((((.{,((,..|}..,{|{(,,,.((((((.((((((((((((.((((....))))..))))))))))))..(((.((((.{.,....,.}.)))).)))........,,.(((((((((.....))).)))))))))))).....))))).)))))).)))..)))))))))))..).))}|((((((((((((((......))))......((((..,,..(((((...((......))...)))))..,.)))),((((...{((((((((((.((((((((......(..(((((.((.((,,,.......}}))))...)))))..)))))))))..,,{{,{,,{,{{,...(((((,{{(((.((((((((((....}))))))))),)))}))))).,,}.)),})),,))))))}})).})....))))......(((,((({{{{.{{{{,..|,,,))))}}|,||}}})),))}.)))))))))))....)))))...))))))))))(((((....,,(((.....)),,,,......(((((.....))))).(((.,,...(((((((({.....})))))))}..}}.)))..,(((((....))))}|((((((.,.(((...,,(,(((((((({(,,,.,,}||||.(((.(((((((....))))))))))(((((.((((....)))))))))..(((((...)))))...,,...,,|||||..}))))))).,,..,,,,,})),,.))))))},)))))})},..)))))))....)))))))))...})))}}))),|||||||||{{{.,,,,,})),)}})))))))))),},.},))))),,}}}},,}}..))),..,)))))}}..))))))))))}.}})),})},|||.{{{{{...)))))))))),.,.}))))))),)),}}}}}))|||{||||}}|||,,||}}||...,.|}|||,...},}}}}.....,,}}},|||....||(((((.{.....}.)))),,|||{{||}|,{,||{,,,|||,}}||.,,,,|},.,}}}},..{,{.,,,{((((((.....)))))}},..}))}))}.,,},.))})})))},.,|,}}})))}}}|{||{..{{{,|},,}....})}))}|||||,|||...,}|||},|||||}}}}|}}}}.||}}}}))))}))}}},{{{||}}}}},,}},,....}),}}..,)))))},,,.))))))))..}}},......))))))..))))})))))..)),......((((({.(((((((((...)))))((((......}})),,.......}))).}))))))))))))).)))),,,...}}.}))))}}))}},},..{{|||.||{|,,|{{{{{..,,.)))).}}|,}}}|.|||||..,,|||,,.,{{{||{||,,.,.........{(.((((.(((.((..(((((.((...((((((((({,..,{(((({..(((..{((((((......(((((((((((((((.((((...(((({...})))).))))))))))))..,(((((((((..........((((.(((((........))))).)))))))))))))|(((((((((.........((((.((.((((.((.(((((((.{{{(((,..{((((((((((,,...(((.(((({,((((....((((...((((((.((....)).))))))))))..))))))))).))),{{{{(((..||{{,..}|||.((..((((.(((...(((...{..((..((((((...))))))..))..}.)))..))).)))).,)),}||{{(({{,.{{||..|||,{{{((((,..}}}}}{||||||{{...||||||}||{{........,,.,,}}},.....},,}}}..}})},.||||,,,,}},.....}}|{{.,,...)}).,.}}}|.))))))},..........)))))))))))))))).))))))))))))).)).)))))))).))))))||}|||,.,,|}}})})})}|||.{{,.{.((((({...)))))).}..))}}))))))}),}}})))))))))))))))))))))))..)).))))))))),}}}|||}}((((((.(((........))).)))))){{|||,{|||}|||}..})))},}}})}}})),)))})))))))))))))))..))))).,....{((((...))))}))))).)))).))))))).))))}}}))}}}},.},}})),}.))))))))))))).........))))..))))))))...)))).))).)))))).))))..((.((((((.......)))))),}|(((((.(((.(((((((({{({.,((((.,......,....)))){((((..{(({{...,}}}},}}}}},{{{.((((((..,.......)))))),}}|((((({{{({..,,.{{{,.,,{{{,(({...{{|..........,,..,))),})},..,,,},.,...)))))))}}..{{.{(((({.........(((((({...,,{,,,.....((((.((((..(((((((.(((.,....,.))).))))))).....)))).)))).{(((,(({,.((((((,(((,(,....{{(((((.......,,..(((((((.....(((((,..((((((((((((.......))))))).((((((((((((((..,.,..(((((((.....)))))))....)))))))))))))),,{{....,.{{{{,...{{{...,)))....|||,{{{..((((.{.((((((..({((((((((((..((((((..{((((.((..(((((...((((((...(((((.((((........)))).)))))....))))))...))))).))))))))))).))..)))))}.,)))).))..)))))).}.))))..}}})))))))))))))))))..}}......,,,,{(({,...((((((.((((((.((.(((((((((...........,(((.{((((((((.,..(((((,.,,.{{(((({.....((((((((....)))))))).}))))))))))))).,,.{{((((({..........))))))))..))))))))},))}((((((((.,..({{(({.((,,.....}}...)).))))............}}....))))))))))))))))))).))))))..)))))).}}}},,..,,,.((((((((((((.....((.(((((.....((((.((((((...(((((((...))))))).)))))))))).....))))).))...)))))))))))).}}})))))))}.}.))),)))))),{{{,{,........,.,})))|{{{{...}}}}}.}}}}}},.,...}}...))))))).........)))))},,...,(((((((({{........}}.)))))))))}).)))))))))...))).)))))...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000264.5 NCBI
ACCCCCUCCCCUCCCCUCCUCCUCUUCUUUCUCCAAAUGGAGAGAGUUC… 8662 nt 0.5236
NM_001083602.3 NCBI
CUGUUUACCCAGGAGGGCUGUGCUGAUAGCACGUUCCUCGAGUUUACUU… 8059 nt 0.4970
NM_001083603.3 NCBI
CUGUUUACCCAGGAGGGCUGUGCUGAUAGCACGUUCCUCGAGUUUACUU… 7905 nt 0.4944
NM_001083604.3 NCBI
ACUCACACCUCUCCAGGAAAAGCAGCAGACAAAUGGGGAUUGAAAAAUU… 7663 nt 0.4931
NM_001083605.3 NCBI
ACUCACACCUCUCCAGGAAAAGCAGCAGACAAAUGGGGAUUGAAAAAUU… 7646 nt 0.4925
NM_001083606.3 NCBI
GGAAUCCAGGGAAGGCGAGCACCCAGACGGGGGCCCGCCGGGGCCGCGG… 7755 nt 0.4961
NM_001083607.3 NCBI
AAUUCAGCUCACACAGCCUCUCCCCACGCUAUGGAAAUGCGUCGGGAGU… 7819 nt 0.4966
NM_001354918.2 NCBI
ACCCCCUCCCCUCCCCUCCUCCUCUUCUUUCUCCAAAUGGAGAGAGUUC… 8506 nt 0.5222
NM_001354919.2 NCBI
CUGUUUACCCAGGAGGGCUGUGCUGAUAGCACGUUCCUCGAGUUUACUU… 1170 nt 0.4983
Summary

This gene encodes a member of the patched family of proteins and a component of the hedgehog signaling pathway. Hedgehog signaling is important in embryonic development and tumorigenesis. The encoded protein is the receptor for the secreted hedgehog ligands, which include sonic hedgehog, indian hedgehog and desert hedgehog. Following binding by one of the hedgehog ligands, the encoded protein is trafficked away from the primary cilium, relieving inhibition of the G-protein-coupled receptor smoothened, which results in activation of downstream signaling. Mutations of this gene have been associated with basal cell nevus syndrome and holoprosencephaly. [provided by RefSeq, Aug 2017] CIViC Summary for PTCH1 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.