Basic Information

Symbol
PTGER4
RNA class
mRNA
Alias
Prostaglandin E Receptor 4 EP4 Prostaglandin E Receptor 4 (Subtype EP4) Prostaglandin E2 Receptor EP4 Subtype PGE2 Receptor EP4 Subtype Prostanoid EP4 Receptor PGE Receptor, EP4 Subtype PGE Receptor EP4 Subtype PTGER2 EP4R
Location (GRCh38)
5:40679915-40693735
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000958.3
Sequence length
3431.0 nt
GC content
0.4972

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1174.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1234.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 996.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000958.3 NCBI
ACAGAGGGUGGAAAGGCGAGAGCGGAGCUCCAAGCCCGGCAGCCCGAGA… 3431 nt 0.4972
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the G-protein coupled receptor family. This protein is one of four receptors identified for prostaglandin E2 (PGE2). This receptor can activate T-cell factor signaling. It has been shown to mediate PGE2 induced expression of early growth response 1 (EGR1), regulate the level and stability of cyclooxygenase-2 mRNA, and lead to the phosphorylation of glycogen synthase kinase-3. Knockout studies in mice suggest that this receptor may be involved in the neonatal adaptation of circulatory system, osteoporosis, as well as initiation of skin immune responses. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PTGER4 is an orthologous gene associated with inflammatory processes in a model of radiation-induced lung injury [Shi et al. DOI:10.17305/bb.2024.10357]. In human skin wound healing, the PTGER4 was identified as a marker for innate lymphoid cells (ILC) [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013]. A study in rats demonstrated that the PTGER4 was upregulated in CD11b/c+ microglia/macrophages from the striatum and prefrontal cortex at 2 hours following a binge methamphetamine regimen, suggesting its involvement in a prostaglandin E2-mediated autocrine feed-forward cycle that promotes inflammatory signaling [Kays et al. DOI:10.3390/brainsci9120340].