Basic Information

Symbol
PTGES3
RNA class
mRNA
Alias
Prostaglandin E Synthase 3 CPGES TEBP P23 Prostaglandin E Synthase 3 (Cytosolic) Cytosolic Prostaglandin E2 Synthase Progesterone Receptor Complex P23 Telomerase-Binding Protein P23 Hsp90 Co-Chaperone EC 5.3.99.3 Unactive Progesterone Receptor, 23 KD Cytosolic Prostaglandin E Synthase
Location (GRCh38)
12:56663338-56688408
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006601.7
Sequence length
1898.0 nt
GC content
0.4015

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-515.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -552.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 453.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282601.2 NCBI
CUCACCACCCCUCGUUUGCACGCACGCACGUUCAUUCUCCGUCCUCGCG… 1835 nt 0.4011
NM_001282602.2 NCBI
CUCACCACCCCUCGUUUGCACGCACGCACGUUCAUUCUCCGUCCUCGCG… 1808 nt 0.4032
NM_001282603.2 NCBI
CUCACCACCCCUCGUUUGCACGCACGCACGUUCAUUCUCCGUCCUCGCG… 1799 nt 0.4019
NM_001282604.2 NCBI
CUCACCACCCCUCGUUUGCACGCACGCACGUUCAUUCUCCGUCCUCGCG… 1947 nt 0.4016
NM_001282605.2 NCBI
CUCACCACCCCUCGUUUGCACGCACGCACGUUCAUUCUCCGUCCUCGCG… 1745 nt 0.4029
NM_006601.7 NCBI
CUCACCACCCCUCGUUUGCACGCACGCACGUUCAUUCUCCGUCCUCGCG… 1898 nt 0.4015
Summary

This gene encodes an enzyme that converts prostaglandin endoperoxide H2 (PGH2) to prostaglandin E2 (PGE2). This protein functions as a co-chaperone with heat shock protein 90 (HSP90), localizing to response elements in DNA and disrupting transcriptional activation complexes. Alternative splicing results in multiple transcript variants. There are multiple pseudogenes of this gene on several different chromosomes. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A review of RNA-Seq studies in post-mortem human brains notes that the PTGES3 gene was found to be abnormally expressed in the prefrontal cortex of human subjects with schizophrenia and bipolar disorder compared to controls [Wu et al. DOI:10.1111/Pcn.12550].